آنالیز ترانسکریپتوم بافت برگ ارقام جو متفاوت در تشکیل زیست توده در مرحله زایشی

کشف همبستگی میان تجمع زیست توده در گیاه و عملکرد، پیش نیاز درک ارتباط بین داده های امیکس و میزان رشد در گیاهان است. برای جستجوی این ارتباط بین ترانسکریپت ها و نقش تنظیمی آنها در تشکیل زیست توده لیگنوسلولزی در فاز زایشی جو، پروفایل ترانسکریپت ها دو هفته پس از گلدهی در 3 لاین جو بهاره مورد استفاده قرار گرفت. یک ریزآرایه سفارشی (custom microarray) متشکل از 56000 اولیگونوکلئوتید برای آنالیز ترانسکریپتوم برگ پرچم در مرحله زایشی استفاده شد. شبکه ی همبستگی ترانسکریپت های درگیر در متابولیسم ثانویه و متابولیسم rna، دارای تعداد بیشتری همبستگی مثبت نسبت به منفی بود که از این بین یک سیگنال ملکول،abh1-cap binding protein بالاترین میزان اتصال را به دیگر ترانسکریپت ها نشان داد. آنالیز آماری یک همبستگی مثبت بین abh1-cap binding protein و یک ژن کلیدی مسیر فنیل پروپانویید، به نام cinnamoyl-coa reductase نشان داد. تلفیق داده های بدست آمده پیشنهاد کننده ی این موضوع هستند که ژن (ccr) cinnamoyl-coa reductase ممکن است بتوانند به عنوان بیومارکر برای مهندسی اصلاح زیست توده لیگنوسلولزی در فاز زایشی جو استفاده شود.