Theoretical Formulation of Principal Components Analysis to Detect and Correct for Population Stratification

نویسندگان
چکیده

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Theoretical Formulation of Principal Components Analysis to Detect and Correct for Population Stratification

The Eigenstrat method, based on principal components analysis (PCA), is commonly used both to quantify population relationships in population genetics and to correct for population stratification in genome-wide association studies. However, it can be difficult to make appropriate inference about population relationships from the principal component (PC) scatter plot. Here, to better understand ...

متن کامل

On convergence of sample and population Hilbertian functional principal components

In this article we consider the sequences of sample and population covariance operators for a sequence of arrays of Hilbertian random elements. Then under the assumptions that sequences of the covariance operators norm are uniformly bounded and the sequences of the principal component scores are uniformly sumable, we prove that the convergence of the sequences of covariance operators would impl...

متن کامل

Adjustment for population stratification via principal components in association analysis of rare variants.

For unrelated samples, principal component (PC) analysis has been established as a simple and effective approach to adjusting for population stratification in association analysis of common variants (CVs, with minor allele frequencies MAF > 5%). However, it is less clear how it would perform in analysis of low-frequency variants (LFVs, MAF between 1% and 5%), or of rare variants (RVs, MAF < 5%)...

متن کامل

Principal Components Analysis of Population Admixture

With the availability of high-density genotype information, principal components analysis (PCA) is now routinely used to detect and quantify the genetic structure of populations in both population genetics and genetic epidemiology. An important issue is how to make appropriate and correct inferences about population relationships from the results of PCA, especially when admixed individuals are ...

متن کامل

stability and attraction domains of traffic equilibria in day-to-day dynamical system formulation

در این پژوهش مسئله واگذاری ترافیک را از دید سیستم های دینامیکی فرمول بندی می کنیم.فرض کرده ایم که همه فاکتورهای وابسته در طول زمان ثابت باشند و تعادل کاربر را از طریق فرایند منظم روزبه روز پیگیری کنیم.دینامیک ترافیک توسط یک نگاشت بازگشتی نشان داده می شود که تکامل سیستم در طول زمان را نشان می دهد.پایداری تعادل و دامنه جذب را توسط مطالعه ویژگی های توپولوژیکی تکامل سیستم تجزیه و تحلیل می کنیم.پاید...

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: PLoS ONE

سال: 2010

ISSN: 1932-6203

DOI: 10.1371/journal.pone.0012510