Protonation states and catalysis: Molecular dynamics studies of intermediates in tryptophan synthase
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Investigation of Structural Dynamics of Enzymes and Protonation States of Substrates Using Computational Tools
This review discusses the use of molecular modeling tools, together with existing experimental findings, to provide a complete atomic-level description of enzyme dynamics and function. We focus on functionally relevant conformational dynamics of enzymes and the protonation states of substrates. The conformational fluctuations of enzymes usually play a crucial role in substrate recognition and c...
متن کاملthe study of bright and surface discrete cavity solitons dynamics in saturable nonlinear media
امروزه سالیتون ها بعنوان امواج جایگزیده ای که تحت شرایط خاص بدون تغییر شکل در محیط منتشر می-شوند، زمینه مطالعات گسترده ای در حوزه اپتیک غیرخطی هستند. در این راستا توجه به پدیده پراش گسسته، که بعنوان عامل پهن شدگی باریکه نوری در آرایه ای از موجبرهای جفت شده، ظاهر می گردد، ضروری است، زیرا سالیتون های گسسته از خنثی شدن پراش گسسته در این سیستم ها بوسیله عوامل غیرخطی بوجود می آیند. گسستگی سیستم عامل...
postnatal studies of bats (pipistrellus kuhlii and miniopterus schreibersii) & histomorphology and histochemistry studies of organs and diseases of (neurergus microspilotus and n. kaiseri)
1. to determine whether difference in birth body mass influenced growth performance in pipistrellus kuhlii we studied a total of 12 captive-born neonates. bats were assigned to two body mass groups: light birth body mass (lbw: 0.89 ± 0.05, n=8) and heavy birth body mass (hbw: 1.35 ± 0.08, n=4). heavier body mass at birth was associated with rapid postnatal growth (body mass and forearm length) ...
molecular and physiological characterizations of floral scent production in rosa damascena mill.
گل محمدی (r. damascena mill.)مهمترین گونه ای است که در تولید گلاب، عطر و اسانس، در صنعت عطرسازی و دارویی کاربرد دارد. با وجود اهمیت عطر گل محمدی، پژوهش های مولکولی و بیوشیمیایی عطر گل این گونه هنوز در مراحل ابتدایی است. در این پژوهش، ویژگی های مولکولی و فیزیولوژیکی تولید عطر در گل محمدی در آزمایش های مختلف مورد بررسی قرار گرفتند. در آزمایش اول، پژوهشی به منظور بررسی تنوع شیمیایی اسانس میان 44 ت...
Surfactant Effects on Tautomeric and Microscopic Equilibria of Tryptophan: Experimental and Theoretical Studies
Surfactant molecules are used as interesting tools to study the structure, function and stability of proteins. Protonation states of amino acids may be changed in the presence of surfactants. In this work, using experimental observations and molecular dynamic simulation, the effects of sodium dodecyl sulfate on the acid dissociation constants of tryptophan was examined. The acid–base equilibriu...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Protein Science
سال: 2015
ISSN: 0961-8368
DOI: 10.1002/pro.2709