Primer borrador del genoma de cepas virulenta y atenuada de Babesia bovis de origen mexicano

Babesia bovis, un parásito protozoario intraeritrocítico transmitido por garrapatas, es uno de los agentes etiológicos la babesiosis bovina, una enfermedad altamente prevalente en las regions tropicales y subtropicales que causa morbilidad mortalidad significativas el Ganado. Para poder eventualmente comparar genomas cepa virulenta atenuada B. objetivo este estudio fue secuenciar ensamblar borrador del genoma para cada parásito. Eritrocitos bovino infectados con dos poblaciones bovis fueron sujetos a extracción ADN genómico fenol cloroformo orgánico. Se utlizaron 20-30 µg población parásitos preparación bibliotecas ADN, réplicas técnicas cepa, utilizando Kit Nextera Xt. La secuenciación se llevó cabo procedimiento tipo escopeta Instituto Biotecnología UNAM. obtuvieron 5,239,525 pares lecturas extremo pareado buena calidad 8,237,626 pareadas virulenta. Los ensamblaron programa Spades v3.13.1. obteniéndose total 625 contigs cobertura 480x 2,274 130x ensamblado demostró contiene 7,962,396 pb, mientras 8,760,816 lo representa diferencia 9.11% recuento bases. Resta realizar anotación identificar diferencias posiblemente estén asociadas virulencia o patogenicidad bovis.