IN-SILICO ALANINE SCANNING ANALYSIS ON THE CATALYTIC RESIDUES OF A NOVEL Β-GLUCOSIDASE FROM TRICHODERMA ASPERELLUM UC1

نویسندگان

چکیده

Currently, the catalytic residue of highly prolific fungal β-glucosidase (BGL) Trichoderma asperellum UC1 remains unvalidated. The study used alanine scanning method to confirm residues BGL as Glu165, Asp226, and Glu423. This cancels out all intermolecular hydrogen bonds with substrates, lignin, hemicellulose, cellulose. Results revealed an overall decline in stability energy-minimized mutant enzymes' compared wild-type BGL. enzyme registered lower PROCHECK (91.0%), ERRAT (93.09%), Verify-3D (98.92%) values, comparison 90.2%, 92.09%, 98.06%, BGL, respectively. UC1-substrate complexes were less stable than enzyme, which exhibited higher binding energies for docked lignin (−7.4% kcal mol-1), cellulose (−7.2 hemicellulose mol-1). Binding corresponding substrates at −7.9 mol-1, −8.1 −7.8 mol-1. An interesting observation was that changed substrate preference order based on calculated energies. bound preferentially lignin>cellulose=hemicellulose, while selective cellulose>lignin>hemicellulose. Hence, findings convey high likelihood Asp 256, Glu423 are T. UC1.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Trichodermaerin: a diterpene lactone from Trichoderma asperellum

The title compound, C20H28O3, known as 'trichodermaerin' [systematic name: (4E)-4,9,15,16,16-penta-methyl-6-oxa-tetra-cyclo-[10.3.1.0(1,10).0(5,9)]hexa-dec-4-ene-7,13-dione], is a diterpene lactone which was isolated from Trichoderma asperellum. The structure has a tetra-cycic 6-5-7-5 ring system, with the cyclo-hexa-none ring adopting a twisted half-chair conformation and the cyclo-pentane rin...

متن کامل

a swot analysis of the english program of a bilingual school in iran

با توجه به جایگاه زبان انگلیسی به عنوان زبانی بین المللی و با در نظر گرفتن این واقعیت که دولت ها و مسئولان آموزش و پرورش در سراسر جهان در حال حاضر احساس نیاز به ایجاد موقعیتی برای کودکان جهت یاد گیری زبان انگلیسی درسنین پایین در مدارس دو زبانه می کنند، تحقیق حاضر با استفاده از مدل swot (قوت ها، ضعف ها، فرصتها و تهدیدها) سعی در ارزیابی مدرسه ای دو زبانه در ایران را دارد. جهت انجام این تحقیق در م...

15 صفحه اول

analysis of power in the network society

اندیشمندان و صاحب نظران علوم اجتماعی بر این باورند که مرحله تازه ای در تاریخ جوامع بشری اغاز شده است. ویژگیهای این جامعه نو را می توان پدیده هایی از جمله اقتصاد اطلاعاتی جهانی ، هندسه متغیر شبکه ای، فرهنگ مجاز واقعی ، توسعه حیرت انگیز فناوری های دیجیتال، خدمات پیوسته و نیز فشردگی زمان و مکان برشمرد. از سوی دیگر قدرت به عنوان موضوع اصلی علم سیاست جایگاه مهمی در روابط انسانی دارد، قدرت و بازتولید...

15 صفحه اول

ABS–Scan: In silico alanine scanning mutagenesis for binding site residues in protein–ligand complex

Most physiological processes in living systems are fundamentally regulated by protein-ligand interactions. Understanding the process of ligand recognition by proteins is a vital activity in molecular biology and biochemistry. It is well known that the residues present at the binding site of the protein form pockets that provide a conducive environment for recognition of specific ligands. In man...

متن کامل

from linguistics to literature: a linguistic approach to the study of linguistic deviations in the turkish divan of shahriar

chapter i provides an overview of structural linguistics and touches upon the saussurean dichotomies with the final goal of exploring their relevance to the stylistic studies of literature. to provide evidence for the singificance of the study, chapter ii deals with the controversial issue of linguistics and literature, and presents opposing views which, at the same time, have been central to t...

15 صفحه اول

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Jurnal teknologi

سال: 2021

ISSN: ['2460-0288']

DOI: https://doi.org/10.11113/jurnalteknologi.v83.15098