Implications biologiques de l’optimisation des irradiations

Gestion des bases de données biologiques sur grilles de calculs

Since the beginning of the eighties, biological databases have considerably grown. A request on the bases which took only a few minutes can now need several days. Meanwhile, the research community in bioinformatics developped itself and specialised laboratories were created all around the world. Collaboration and exchanges between teams that were sometimes geographically very far from each othe...

Utilisation Des Algorithmes Genetiques Pour L’analyse De Sequences Biologiques

Représentation systémique multi-échelle des processus biologiques de la bactérie

HAL is a multi-disciplinary open access archive for the deposit and dissemination of scientific research documents, whether they are published or not. The documents may come from teaching and research institutions in France or abroad, or from public or private research centers. L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est destinée au dépôt et à la diffusion de documents scientifiques de niveau...

Modélisation des systèmes biologiques par la théorie des réseaux de jeux

RÉSUMÉ. Dans cet article, nous présentons une modélisation des interactions biologiques par la théorie des jeux. Dans un premier temps, nous appliquons cette modélisation à un réseau de régulation génétique. Dans un deuxième temps nous l’appliquons au système activateur du plasminogène (PAs, Plasminogen Activator system) qui représente un réseau d’interactions biologiques impliqué dans la migra...

Combinaison de modèles phylogénétiques et longitudinaux pour l'analyse des séquences biologiques : reconstruction de HMM profils ancestraux

Statistical modelling of homologous sequences through profile HMM disregards thephylogenetic links between those. Here we present models harnessing an efficient com-bination of horizontal and vertical features, simultaneously figuring sequences as chainsof aminoacids and products of an evolutionary process. Suchmodels belong to the phylo-HMM family introduced in the ’90s (e.g. M...