Flexible metagenome analysis using the MGX framework
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Metagenome Analysis Using Megan
In metagenomics, the goal is to analyze the genomic content of a sample of organisms collected from a common habitat. One approach is to apply large-scale random shotgun sequencing techniques to obtain a collection of DNA reads from the sample. This data is then compared against databases of known sequences such as NCBI-nr or NCBI-nt, in an attempt to identify the taxonomical content of the sam...
متن کاملFlexible and Accessible Workflows for Improved Proteogenomic Analysis Using the Galaxy Framework
Proteogenomics combines large-scale genomic and transcriptomic data with mass-spectrometry-based proteomic data to discover novel protein sequence variants and improve genome annotation. In contrast with conventional proteomic applications, proteogenomic analysis requires a number of additional data processing steps. Ideally, these required steps would be integrated and automated via a single s...
متن کاملrodbar dam slope stability analysis using neural networks
در این تحقیق شبکه عصبی مصنوعی برای پیش بینی مقادیر ضریب اطمینان و فاکتور ایمنی بحرانی سدهای خاکی ناهمگن ضمن در نظر گرفتن تاثیر نیروی اینرسی زلزله ارائه شده است. ورودی های مدل شامل ارتفاع سد و زاویه شیب بالا دست، ضریب زلزله، ارتفاع آب، پارامترهای مقاومتی هسته و پوسته و خروجی های آن شامل ضریب اطمینان می شود. مهمترین پارامتر مورد نظر در تحلیل پایداری شیب، بدست آوردن فاکتور ایمنی است. در این تحقیق ...
Annotation of metagenome short reads using proxygenes
MOTIVATION A typical metagenome dataset generated using a 454 pyrosequencing platform consists of short reads sampled from the collective genome of a microbial community. The amount of sequence in such datasets is usually insufficient for assembly, and traditional gene prediction cannot be applied to unassembled short reads. As a result, analysis of such datasets usually involves comparisons in...
متن کاملanalysis of power in the network society
اندیشمندان و صاحب نظران علوم اجتماعی بر این باورند که مرحله تازه ای در تاریخ جوامع بشری اغاز شده است. ویژگیهای این جامعه نو را می توان پدیده هایی از جمله اقتصاد اطلاعاتی جهانی ، هندسه متغیر شبکه ای، فرهنگ مجاز واقعی ، توسعه حیرت انگیز فناوری های دیجیتال، خدمات پیوسته و نیز فشردگی زمان و مکان برشمرد. از سوی دیگر قدرت به عنوان موضوع اصلی علم سیاست جایگاه مهمی در روابط انسانی دارد، قدرت و بازتولید...
15 صفحه اولذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Microbiome
سال: 2018
ISSN: 2049-2618
DOI: 10.1186/s40168-018-0460-1