Cleaning the GenBank Arabidopsis thaliana data set
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Cleaning the GenBank Arabidopsis thaliana data set.
Data driven computational biology relies on the large quantities of genomic data stored in international sequence data banks. However, the possibilities are drastically impaired if the stored data is unreliable. During a project aiming to predict splice sites in the dicot Arabidopsis thaliana, we extracted a data set from the A.thaliana entries in GenBank. A number of simple 'sanity' checks, ba...
متن کاملکنترل ژنتیکی گلدهی در گیاه آرابیدوپسیس (Arabidopsis thaliana)
انتقال از رشد رویشی به فاز زایشی از تحولات مهم در زندگی گیاهان می‌باشد. این پدیده در گیاهان عالی تحت تاثیر بسیاری از عوامل ژنتیکی و فیزیولوژیکی می‌باشد. شناسایی این عوامل یکی از اهداف مهم در اصلاح بسیاری از گیاهان می‌باشد. در دهه‌های اخیر گیاه آرابیدوپسیس به عنوان یک گیاه مدل در بسیاری از مطالعات مربوط به عمل گلدهی به کار رفته است و بسیاری از مسیرهای مربوط به کنترل گلدهی در این گیاه مشخص شده اس...
متن کاملکنترل ژنتیکی گلدهی در گیاه آرابیدوپسیس (Arabidopsis thaliana)
انتقال از رشد رویشی به فاز زایشی از تحولات مهم در زندگی گیاهان می‌باشد. این پدیده در گیاهان عالی تحت تاثیر بسیاری از عوامل ژنتیکی و فیزیولوژیکی می‌باشد. شناسایی این عوامل یکی از اهداف مهم در اصلاح بسیاری از گیاهان می‌باشد. در دهه‌های اخیر گیاه آرابیدوپسیس به عنوان یک گیاه مدل در بسیاری از مطالعات مربوط به عمل گلدهی به کار رفته است و بسیاری از مسیرهای مربوط به کنترل گلدهی در این گیاه مشخص شده اس...
متن کاملکلن کردن ژنRGL2 از DNA ژنومی آرابیدوپسیس (Arabidopsis thaliana)
یکی از ژنهایی که در سنتز جیبرلین در گیاه شناخته شده و موقعیت آنها در ژنوم آرابیدپسیس مشخص شده است، RGL2 می‌باشد که در این بررسی کلن گردید. با استخراج DNA از آرابیدوپسیس، اکوتیپ کلمبیا و استفاده از آغازگرهای اختصاصی که بر اساس توالی ژن مورد نظر ساخته شده بودند، این ژن تکثیر شد. پلاسمید PET-32a (+)و ژن تکثیر شده با استفاده از دو آنزیم برشی خاص به نامهای Nco I و Sal I برش داده شدند. پس از اتصال ژ...
متن کاملDAtA: Database of Arabidopsis thaliana Annotation
The Database of Arabidopsis thaliana Annotation (D At A) was created to enable easy access to and analysis of all the Arabidopsis genome project annotation. The database was constructed using the completed A.thaliana genomic sequence data currently in GenBank. An automated annotation process was used to predict coding sequences for GenBank records that do not include annotation. D At A also con...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Nucleic Acids Research
سال: 1996
ISSN: 1362-4962
DOI: 10.1093/nar/24.2.316