Automated muscle histopathology analysis using CellProfiler
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
CellProfiler: free, versatile software for automated biological image analysis.
Careful visual examination of biological samples is quite powerful, but many visual analysis tasks done in the laboratory are repetitive, tedious, and subjective. Here we describe the use of the open-source software, CellProfiler, to automatically identify and measure a variety of biological objects in images. The applications demonstrated here include yeast colony counting and classifying, cel...
متن کاملNovel Automated Method for Minirhizotron Image Analysis: Root Detection using Curvelet Transform
In this article a new method is introduced for distinguishing roots and background based on their digital curvelet transform in minirhizotron images. In the proposed method, the nonlinear mapping is applied on sub-band curvelet components followed by boundary detection using energy optimization concept. The curvelet transform has the excellent capability in detecting roots with different orient...
متن کاملrodbar dam slope stability analysis using neural networks
در این تحقیق شبکه عصبی مصنوعی برای پیش بینی مقادیر ضریب اطمینان و فاکتور ایمنی بحرانی سدهای خاکی ناهمگن ضمن در نظر گرفتن تاثیر نیروی اینرسی زلزله ارائه شده است. ورودی های مدل شامل ارتفاع سد و زاویه شیب بالا دست، ضریب زلزله، ارتفاع آب، پارامترهای مقاومتی هسته و پوسته و خروجی های آن شامل ضریب اطمینان می شود. مهمترین پارامتر مورد نظر در تحلیل پایداری شیب، بدست آوردن فاکتور ایمنی است. در این تحقیق ...
Automatic Image Analysis of Histopathology Specimens Using Concave Vertex Graph
Automatic image analysis of histopathology specimens would help the early detection of blood cancer. The first step for automatic image analysis is segmentation. However, touching cells bring the difficulty for traditional segmentation algorithms. In this paper, we propose a novel algorithm which can reliably handle touching cells segmentation. Robust estimation and color active contour models ...
متن کاملanalysis of ruin probability for insurance companies using markov chain
در این پایان نامه نشان داده ایم که چگونه می توان مدل ریسک بیمه ای اسپیرر اندرسون را به کمک زنجیره های مارکوف تعریف کرد. سپس به کمک روش های آنالیز ماتریسی احتمال برشکستگی ، میزان مازاد در هنگام برشکستگی و میزان کسری بودجه در زمان وقوع برشکستگی را محاسبه کرده ایم. هدف ما در این پایان نامه بسیار محاسباتی و کاربردی تر از روش های است که در گذشته برای محاسبه این احتمال ارائه شده است. در ابتدا ما نشا...
15 صفحه اولذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Skeletal Muscle
سال: 2018
ISSN: 2044-5040
DOI: 10.1186/s13395-018-0178-6