A regularized functional regression model enabling transcriptome-wide dosage-dependent association study of cancer drug response

نویسندگان
چکیده

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Regularized regression method for genome-wide association studies

We use a novel penalized approach for genome-wide association study that accounts for the linkage disequilibrium between adjacent markers. This method uses a penalty on the difference of the genetic effect at adjacent single-nucleotide polymorphisms and combines it with the minimax concave penalty, which has been shown to be superior to the least absolute shrinkage and selection operator (LASSO...

متن کامل

Discretization of a fractional order ratio-dependent functional response predator-prey model, bifurcation and chaos

This paper deals with a ratio-dependent functional response predator-prey model with a fractional order derivative. The ratio-dependent models are very interesting, since they expose neither the paradox of enrichment nor the biological control paradox. We study the local stability of equilibria of the original system and its discretized counterpart. We show that the discretized system, which is...

متن کامل

A genome-wide association study of acenocoumarol maintenance dosage.

Several genome-wide association studies have been performed on warfarin. For acenocoumarol, the most frequently used coumarin in many countries worldwide, pharmacodynamic influences are expected to be comparable. Pharmacokinetics however might differ. We aimed to confirm known or identify new genetic variants contributing to interindividual variation on stabilized acenocoumarol dosage by a GWAS...

متن کامل

Semantically enabling a genome-wide association study database

UNLABELLED BACKGROUND The amount of data generated from genome-wide association studies (GWAS) has grown rapidly, but considerations for GWAS phenotype data reuse and interchange have not kept pace. This impacts on the work of GWAS Central - a free and open access resource for the advanced querying and comparison of summary-level genetic association data. The benefits of employing ontologies...

متن کامل

the study of aaag repeat polymorphism in promoter of errg gene and its association with the risk of breast cancer in isfahan region

چکیده: سرطان پستان دومین عامل مرگ مرتبط با سرطان در خانم ها است. از آنجا که سرطان پستان یک تومور وابسته به هورمون است، می تواند توسط وضعیت هورمون های استروئیدی شامل استروژن و پروژسترون تنظیم شود. استروژن نقش مهمی در توسعه و پیشرفت سرطان پستان ایفا می کند و تاثیر خود را روی بیان ژن های هدف از طریق گیرنده های استروژن اعمال می کند. اما گروه دیگری از گیرنده های هسته ای به نام گیرنده های مرتبط به ا...

15 صفحه اول

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: PLOS Computational Biology

سال: 2021

ISSN: 1553-7358

DOI: 10.1371/journal.pcbi.1008066