با توجه به توسعه جوامع انسانی و نیاز به آب بیشتر کمبود منابع آب یکی از مهمترین چالش های پیش روی بشر می باشد.رودخانه ها مهمترین منبع تامین آب مورد نیاز انسان ها در بخش های گوناگون (شرب، کشاورزی و صنعت) می باشند. رودخانه کارون پرآب ترین رودخانه کشور و منبع اصلی تأمین آب مورد نیاز بخش های مختلف در استان خوزستان می باشد و کیفیت آب در آن یکی از عوامل اصلی کنترل کننده منافع کشور می باشد. با توجه به وقوع خشکسالی های اخیر و افزایش برداشت ها و مصارف روزافزون و تخلیه پساب ها به رودخانه و همچنین اجرای طرح های انتقال بین حوضه ای آب، بررسی کیفیت آب در وضع کنونی و تأثیر تغییرات دبی جریان بر کیفیت رودخانه کارون امری ضروری به نظر می رسد. بدین منظور در این تحقیق از مدل ریاضی qual2k برای شبیه سازی کیفی رودخانه کارون در اثر تغییرات میزان آورد استفاده شده است. با در نظر گرفتن این نکته که بیشترین تمرکز جمعیتی در استان در حوضه پایاب کارون وجود دارد این منطقه برای این مطالعه در نظر گرفته شد. نتایج شبیه سازی نشان دهنده وضعیت آلوده و نامطلوب رودخانه در ماه های خشک و کم-آب است. همچنین با ادامه وضع موجود و اجرا شدن طرح های انتقال آب از سرشاخه ها شاهد وقوع این وضع نامطلوب در بیشتر ماه های سال خواهیم بود که در ماه های خشک و کم آب این وضعیت خطرناک تر خواهد بود.