نام پژوهشگر: محمد بهبودی مقدم عربانی

ردیابی عوامل بیماری زنگ زرد و قهوه ای گندم و جو با استفاده از real-time pcr
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه زابل - دانشکده کشاورزی 1388
  محمد بهبودی مقدم عربانی   حسین جعفری

گندم غذای اصلی انسان است. مهمترین بیماری این گیاه که سالانه مقادیر زیادی از محصول را از بین می برد، بیماری زنگ غلات است. ردیابی و شناسایی سریع این بیماری قبل از بروز اپیدمی می تواند در ایجاد یک سیستم پیش آگاهی جهت کنترل به موقع و جلوگیری از خسارت بالا به محصولات مفید باشد. روشهای مرفولوژیکی جهت شناسایی این عوامل بیماری از دقت و سرعت لازم برخوردار نیستند. روش های مولکولی مرسوم نیز نیاز به مقادیر زیادی اسپور برای شناسایی این قارچ ها دارند. در این مطالعه برای بر طرف کردن این مشکل و ردیابی و شناسایی سریع سه قارچ p. striiformi، p. triticina و p. recondita از تکنیک real-time pcr استفاده گردید. پس از جمع آوری یوریدیوسپورهای این سه زنگ ابتدا شناسایی مرفولوژیکی بر روی یوریدیوسپور صورت گرفت. سپس استخراج dna از این نمونه ها انجام شد و منطقه its1 آنها توسط pcr تکثیر گردید. سپس ناحیه its1 دو قارچ p. triticina و p. recondita جهت مقایسه با توالی its1 این دو قارچ که در ژن بانک موجود است توالی یابی گردید و شباهت معنی داری بین هر کدام از این دو گونه و توالی آن در بانک ژن نشان داده شد. توالی یابی توانست با احتمال 98 درصد این دو قارچ را شناسایی کند. همچنین ناحیه s 28 به عنوان کنترل داخلی در تمام نمونه ها تکثیر گردید. نمونه های هر قdnaارچ با پروب اختصاصی آن توسط real-time pcr تشخیص داده شد. پروب ها توانستند نمونه ها را به طور اختصاصی تکثیر دهند. نتایج این مطالعات نشان داد که تکنیک real-time pcr می تواند تفکیک قارچ ها را به طور کامل انجام داده و dna زنگ ها را تا حدود 1 پیکوگرم شناسایی کند.