چکیده سرطان کولورکتال سومین سرطان در مردها و دومین سرطان در زنان در سراسر دنیا می باشد.در ایران میزان مرگ و میر ناشی از این بیماری 8-6 از هر 000/100 نفر می باشد. روش های تشخیص متداول این بیماری بررسی خون مخفی در مدفوع، سنجش تومور مارکر cea و کولونوسکوپی می باشد. دو روش اول غیر اختصاصی است و کولونوسکوپی نیز یک روش تهاجمی می باشد که انجام آن برای بیمار بسیار مشکل است. این بیماری اگر در مراحل اولیه تشخیص داده شود بهبودی بالایی دارد ولی این تومور در مراحل اولیه بدلیل عدم علایم بالینی مشخص قابل شناسایی نمی باشد. یکی از روشهای تشخیص سریع سرطان ها استفاده از علم متابونومیک جهت یافتن الگوی متابولیکی فرد مبتلا می باشد لذا برای شناسایی و مقایسه الگوی متابولیکی پلاسما بین بیماران مبتلا به سرطان کولون و افراد سالم با استفاده از 1hnmr اسپکتروسکوپی این تحقیق انجام شد. متابونومیکس را می توان به عنوان سنجش کمی همکنش های متابولیکی وابسته به زمان، در یک سیستم زنده، به پاسخ محرک های پاتوفیزیولوژی یا تغییرات ژنتیکی تعریف کرد. روش آنالیز آن استفاده از دستگاههای ms و یا 1hnmr می باشد. این تحقیق بر روی 20 فرد مبتلا به سرطان کولورکتال و 20 فرد سالم انجام شد که تمامی افراد جهت انجام آزمایش کولونوسکوپی به مدت 48 ساعت فقط مایعات مصرف نمودند. جهت جداسازی پلاسمای این افراد 4 میلی لیتر از نمونه خون به لوله های حاوی 20 میکرولیتر هپارین (ماده ضد انعقاد) اضافه شد و سپس نمونه ها به مدت 15 دقیقه با دور rpm3000 سانتریفوژ شدند تا پلاسمای خون آنها جدا شود. در مرحله بعد 800 میکرولیتر از پلاسمای به دست آمده با 10 در صد d2o رقیق شد و آزمایش 1hnmr اسپکتروسکوپی با روش spin echo cpmg جهت بدست آوردن طیف بر روی نمونه ها انجام شد و متابولیتهای طیف با استفاده از نرم افزار mestrenova تعیین شدند. سپس نتایج به دست آمده با استفاده از نرم افزار مطلب و روش pca و pls در کمومتریکس بررسی شدند. الگوی متابولیکی به دست آمده افراد سالم و بیمار کاملاً از یکدیگر تفکیک شدند و متابولیتهای گلیسین، ? - گلوکز، فوکوز، d - گالاکتوز و کراتینین به عنوان متابولیتهای اولیه جهت جداسازی شناخته شدند.

بهینه سازی نقش مهمی در حل بسیاری از مسائل دنیای امروز دارد ازآن جمله، می توان به مباحث موجود در مهندسی سازه اشاره کرد. به همین جهت با توسعه علم کامپیوتر روش های بهینه سازی فراوانی ابداع گردیده است. روش های معمول برای بهینه سازی روش های مبتنی برگرادیان و روش های غیرگرادیانی می باشد. الگوریتم جامعه پرندگان یک روش غیر گرادیانی مبتنی بر هوش دسته جمعی است. این روش با تولید جواب های اولیه تصادفی و بهبود آن ها در طول فرایند بهینه سازی به جستجوی جواب بهینه کلی می پردازد. روش مجانب های متحرک روشی مبتنی بر گرادیان می باشد که با شروع از یک نقطه به پیدا کردن جواب بهینه با استفاده از اطلاعات گرادیان می پردازد. در این رساله جهت بهینه سازی وزن خرپا، متغیرهای مختلط یعنی سطح مقطع اعضا به عنوان متغیر گسسته و موقعیت مکانی گره های خرپا به عنوان متغیر پیوسته طراحی، انتخاب شده است به طوری که قیود مورد نظرمان، محدودیت تنش ها، محدودیت تغییرمکان ها اقناع شده اند. بهینه سازی سطح مقطع اعضا توسط الگوریتم جامعه پرندگان اصلاح شده و بهینه سازی موقعیت گره ها توسط روش مجانب های متحرک صورت گرفته است. برای بهینه سازی همزمان اندازه و شکل خرپا، این دو روش به صورت ترکیبی بکارگرفته شده اند که نتایج بدست آمده در این تحقیق در مقایسه با سایر منابع از کیفیت مناسب تری برخوردار می باشد.

تمایز سلولی و بدخیمی در سلول‏های اصلی غده تیروئید، موسوم به سرطان تیروئید تمایز یافته(dtc) differentiated tyroid carsinoma شایعترین نوع سرطان تیروئید می‏باشد. مهمترین عامل سرطانزای شناخته شده در تیروئید، قرار گرفتن در معرض دوز بالای اشعه یونیزه است که موجب جهش در dna میگردد. یکی از مکانیزم‏های مهم دفاعی بدن در جهت حذف اینگونه جهش‏های ناخواسته، "مسیر نوترکیبی همولوگ" (نوترکیبی در توالی‏های مشابه) است که در طی آن، همکاری چند ژن باعث جایگزین شدن بازهای قبلی بجای بازهای جهش‏یافته و در نتیجه ترمیم dnaی آسیب دیده می‏گردد. یکی از ژن‏های مهم این مسیر، ژن rad51است. با درک اهمیت عملکرد ژن‏های این مسیر در ترمیم dna می‏توان حدس زد هر گونه تغییر در ساختار ژن rad51 و ژن‏های مرتبط با آن می‏تواند امر ترمیم dna را مختل و موجب پدیدار شدن جهش و بروز سرطان گردد. بنابراین از ارتبا ط جهش (که می‏تواند به شکل جابجایی در یک نوکلئوتید یا snp باشد) با بالا رفتن ریسک سرطان، می‏توان به عنوان یک "فاکتور پیش آگهی" مهم در امر غربالگری بیماران استفاده نمود. در مطالعات قبلی از ارتباط جایگزین شدن سیتوزین بجای گوانین در ناحیه 135 ژن rad51 rad51 135 g>c)) و بالا رفتن ریسک سرطان پستان، نتایج معنی‏داری بدست آمده است و در پی آن، ارتباط این snp با دیگر سرطان‏ها در جمعیت‏های مختلف جهان در حال بررسی می‏باشد. در این مطالعه به ارتباط اینsnp با افزایش ریسک سرطان تیروئید تمایز یافته (dtc) در محدوده‏ای از جمعیت ایران پرداخته‏ایم. جهت انجام این مطالعه مورد شاهدی، پس از نمونه‏گیری و تخلیص dna به روش salting out جهت بررسی وجود این snp تمام نمونه‏ها تحت pcr-rflp قرار گرفت. پس از مقایسه توالی‏های مشاهده شده با hardy–weinberg equilibrium و مشاهده هیچگونه جهشی نه در گروه بیمار و نه در گروه کنترل، ریسک نسبی به عنوان ((or با 95% اطمینان توسط آنالیز logistic regression analyses بیان شد.gg+cg or(95%ci) 0.54-1.67. نتایج بدست آمده از این مطالعه ارتباط معنی‏داری را بین افزایش ریسک سرطان dtc با snp مورد آزمایش نشان نداد. بهرحال رد یا قبول این فرضیه منوط به مطالعات بعدی در جمعیت‏های بزرگتر می‏باشد.

چکیده : مالاریا مهم ترین بیماری انگلی و یکی از مسایل مهم بهداشتی تعدادی از کشورها بخصوص کشورهای گرمسیری دنیا است. این بیماری به صورت عفونت حاد در بیشتر موارد وخیم و گاهی طولانی و با ویژگیهای تب متناوب و لرز، کم خونی و بزرگی طحال و گاه با ویژگیهای ساده یا کشنده دیگر خودنمایی می کند. اهمیت این بیماری به خاطر شیوع زیاد و مرگ ومیر قابل توجه است لذا دانشمندان درپی جستجو دارویی جهت مهارکردن این بیماری هستند. پیشگیری قطعی بیماری نیاز به دارویی دارد که بعد از ورود اسپروزوییت به میزبان از سیر تکاملی و سریع آن جلوگیری کند. داروهایی مانند پریماکین و پروگوانیلدر تنها مانع سیر تکاملی انگل در سلول های کبدی قبل از ورود آن به مرحله خونی می شوند.لذا تحقیقاتی باید صورت بگیرد تا داروهای جدیدی با کارایی بالاتر و اثر سمیت کمتر عرضه شود. در این مطالعه انگل پلاسمودیم فالسیپارم کشت داده شد و پس از جداسازی انگل در دو فاز رینگ و تروفوزوئت و استخراج متابولیت های دو فاز، نمونه جهت طیف سنجی nmr آماده سازی شد . طیف سنجی به کمک دستگاه mhz 500 hnmr bruker 1 انجام گردید و در ادامه داده های بدست آمده را به کمک نرم افزار متلب و همچنین کد محاسباتی prometab که به عنوان یک ابزار آنالیز داده های متابولومیکس می باشد پردازش شد ، سپس داده های پردازش شده حاصل از این کد محاسباتی را توسط نرم افزار های کاهش دهنده چند متغیره آنالیز اجزاء اصلی (pca) مورد آنالیز قرار داده و نهایتاً پس از بدست آوردن جابجایی شیمیایی متابولیت های مربوطه و مراجعه به بانک اطلاعات متابولوم، مسیر های شیمیایی و پروفایل متابولوم متابولیت های فاز رینگ و تروفوزوئیت را مورد مطالعه و بررسی قرار داده شد . با توجه به اینکه پلاسمودیوم فالسیپارم گونه خطرناک انگل مالاریا می باشد. آنالیز پروفایل متابولوم این گونه ی انگل،در دو فاز رینگ و تروفوزیت می تواند تغییرات مهم متابولیسمی دو فاز را بیان نموده و نهایتاً می تواند منجر به کشف تارگت های دارویی جدید و موثر در جهت درمان بیماری مهلک و کشنده ی مالاریا گردد. واژگان کلیدی : مالاریا ? فالسیپاروم ? پروفایل متابولیکی رینگ ? تروفوزیت

چکیده: در ایران، سالانه حدوداً 1 % عقرب گزیدگی در شهرها و بیش از 5% عقرب گزیدگی در نواحی روستایی گزارش گردیده است.این نوع عقرب در استان خوزستان و سایر قسمت های غربی کشور اندمیک می باشد.عقرب همیسکورپیوس لپتوروس(گادیم) متعلق به خانواده ی اسکورپیونیده بوده و مسئول بیش از 10% عقرب گزیدگی در استان خوزستان می باشد، اما سم این عقرب باعث 95% مرگ و میر در افراد می شود. این گونه عقرب به علت دارا بودن سم سیتوتوکسیک و نوروتوکسیک التهابات و زخم های شدیدی را ایجاد می کند که می توان به اریتما، تاول، تغیرات پورپورا، نکروز، زخم و یا ترکیبی از آن ها اشاره کرد . اثرات توکسیک سم این عقرب باعث تغییرات گسترده در متابولیت های اولیه و ثانویه در سیستم های زنده می شود. متابونومیکس مطالعه ی سیستماتیک ردپای(فینگر پرینت) شیمیایی ناشی از واکنش های سلولی است. و یک روش مناسب برای مطالعه ی مکانیسم های سمیت و بیماری ها به کمک تکنولوژی رزونانس مغناطیسی هسته(nmr) می باشد.در این مطالعه پروفایل متابولیکی سرم موش عقرب گزیده را برای یافتن فینگر پرینت تغییرات متابولیکی مورد مطالعه قرار دادیم. مواد و روش ها: تعداد 30 سر رت از گونه ی ویستار در این مطالعه استفاده شد.رت ها به سه گروه تقسیم شده و در هر گروه 10 سر رت قرار گرفت. 1- گروه کنترل(شاهد): به این گروه µg/ml 200 نرمال سالین به صورت زیرپوستی تزریق کرده و بعد از 30 دقیقه ، رت ها را بیهوش کرده و از قلب آنها خون گرفته و سرم آن را جدا کرده و تا زمان انجام آزمایشات nmr در دمای 80- درجه ی سانتی گراد قرار دادیم. 2- گروه آزمایشی اول: به این گروه 200 میکرولیتر از سم عقرب تزریق کرده(ld-50=200µg/ml) و مانند گروه شاهد بعد از 30 دقیقه رت ها را بیهوش کرده و سرم جدا شده را در 80- درجه ی سانتی گراد قرار دادیم. 3- گروه آزمایشی دوم: به این گروه µg/ml 200 از سم عقرب تزریق کرده و بعد از 24 ساعت رت ها را بیهوش کرده و از قلب آنها خون گرفته و سرم آن را جدا کرده و تا زمان انجام آزمایشات nmr در دمای 80- درجه ی سانتی گراد قرار دادیم. از این نمونه به کمک دستگاه nmr bruker 500 mhz و پروتکلcpmg طیف گرفته و داده های متابولیتی را به کمک روش pca و نرم افزارهای کنومکس و پرومتاب آنالیز و طبقه بندی کردیم.داده های به دست آمده را با داده های بانک متابولیتی nmr مقایسه کرده و متابولیت هایی که تغییر محسوسی داشتند را شناسایی کرده و در سایت(www.metaboanalyst.ca) مسیر های متابولیکی تحت تاثیر قرار گرفته را شناسایی نمودیم. نتیجه گیری: نتایج نشان می دهد که شماری از متابولیت ها که تغیرات زیادی طی مسمومیت با سم عقرب یافتند، می توانند به عنوان مارکر در این نوع عقرب گزیدگی در نظر گرفته شوند از جمله: بتا آلانین، هیستیدین و متیل مالونیک اسید. واژگان کلیدی: متابونومیکس، کنومکس، پروفایل متابولیکی، nmr

در این پایان نامه مدل سازی و کنترل ژنراتور القایی دوسوتغذیه (dfig) به همراه توربین بادی سرعت متغیر در حالت متصل به شبکه انجام شده است. مدل دینامیکی سیستم مذکور در دستگاه مرجع سنکرون d-q شبیه سازی شده است. همچنین یک روش کنترل توان راکتیو به منظور تثبیت ولتاژ در مکان های دور از شبکه قدرت، ارائه شده است. در این روش توان راکتیو تولیدی مبدل های منبع ولتاژ (vscs) به گونه ای کنترل می شود که dfig و مبدل ها از شرایط نامی خود تجاوز نکند. علاوه براین، یک مزرعه بادی با ژنراتورهای القایی دوسوتغذیه در چند ساختار بررسی و شبیه سازی شده است. همچنین روشی جدید برای کنترل سرعت و توان dfigها، به منظور دریافت بیشینه توان از باد، استفاده شده است. در ابتدا، یک لینک dc مشترک برای dfig ها در نظر گرفته شده و این لینکdc از طریق یک مبدل به شبکه وصل و تثبیت می شود. بنابراین در تعداد مبدل ها نسبت به توربین های بادیdfig متعارف صرفه جویی شده است. سپس، در لینک dc یک باطری فرض شده است و بنابراین از قابلیت کنترل توان اکتیو مبدل سمت شبکه برای جبران سازی نوسانات توان اکتیو خط انتقال استفاده شده است. همچنین استفاده از مبدل سری در مزرعه بادی به عنوان یک مورد مطالعاتی بررسی شده است. هدف نهایی این پایان نامه، طراحی مطلوب کنترل کننده های dfig در ساختارهای مختلف پیشنهادی، در راستای دریافت بیشینه توان از انرژی باد، و بهبود کیفیت توان می باشد. شبیه سازی ها توسط نرم افزارهای pscad/emtdc و matlab/simulink انجام شده و نتایج آن، صحت عملکرد ساختارهای کنترلی جدید در بهبود پارامتر های کیفیت توان (مثل جبران سازی کاهش ولتاژ، افزایش ولتاژ و فلیکر) را نشان می دهد.

یک فرآیند مهم در چرخه زندگی پلاسمودیوم فالسیپاروم تهاجم به گلبولهای قرمز انسان است. ورود به سلولهای میزبان نیازمند آنتی ژن ama1 می باشد. بدلیل اینکه در یوکاریتوها آنتی بادیهایی که بر علیه این آنتی ژن ایجاد می شود می تواند مانع تهاجم شود بنابراین ama1 یکی از اهداف اولیه در تولید واکسن به شمار می رود. گفته می شود گلیکوزیلاسیون پروتئینهای سطحی در بسیاری از اعمال سلولی نظیر شناسایی سلولها سیگنالینگ و خاصیت آنتی ژنی نقش دارد. عقیده بر این است که کربوهیدراتهای موجود در سطح انگل مالاریا توسط سیستم ایمنی میزبان شناسایی می شوند. در این پژوهش تصمیم بر تلخیص آنتی ژن ama1 از انگل پلاسمودیوم فالسیپاروم گرفته شد. برای اینکار از روش استفاده شده متدوال (tragger and jonson) و روش دوم که روش تغییر یافته از متد (raadfar) بود با این روش درصد پارازیتمی 80% افزایش یافت. نمونه های انگل با استفاده از بافر مخصوص اولتراسانتریفیوژ شده و آنتی ژنها جدا شدند و سپس برای انجام sds page مورد استفاده قرار گرفتند و سپس با استفاده از روش الکتروالیوشن تلخیص و با استفاده از لوله های مخصوص تغلیظ شدند پس از این مراحل و انجام sds page با استفاده از رنگ آمیزی نیترات نقره مورد بررسی قرار گرفتند. پس از آن ایمونوبلاتینگ انجام گرفت و جهت بررسی گلیکوزیلاسیون آنتی ژن مورد نظر از کیت q proteome oglycan glycol protein kit qproteome total glycoprotein kit استفاده شد. در نتیجه این بررسیها از آنتی ژن تلخیص شده پس از انجام sds page و رنگ آمیزی نیترات نقره در موقعیت 83kda یک باند حاصل شد. همچنین پس از انجام بلاتینگ نیز یک باند منفرد در محل kda 83 حاصل آمد در بررسیهایی که با کیت به عمل آمد نیز هر دو نوع گلیکوپروتئین نوع n و o بدست آمد در نهایت برای مقایسه با انواع طبیعی این آنتی ژن با نوع نو ترکیب و سنتیک آن به بررسی آماری پرداخته شد که نتایج حاصل عدم وجود سایتهای گلیکوزیلاسیون مناسب بر روی نمونه های نو ترکیب را اثبات نمود

لیشمانیوز یکی از بیماریهای انگلی شایع در ایران و بسیاری از کشورهای جهان می باشد. این بیماری که در شمار بیماریهای مشترک انسان و حیوان است، در 88 کشور جهان وجود دارد که به صورت ضایعات پوستی (سالک)، احشایی(کالاازار)، و مخاطی _ پوستی بروز می کند. عامل بیماری لیشمانیوز، تک یاخته ای به نام لیشمانیا است، که بر حسب محیط زندگی خود به دو شکل بدون تاژک (آماستیگوت یا جسم لیشمن)، و تاژک دار(پروماستیگوت) دیده می شود. انگل لیشمانیا در طی سیکل زندگی خود دو فاز لگاریتمی و ایستایی را تجربه می کند که ویژگی ها و متابولیت های این دو فاز با یکدیگر متفاوت می باشد. لیشمانیوزها عموما توسط گونه های پشه خاکی (به فرم پروماستیگوت) به بدن مهره داران منتقل می شوند. امروزه تکنیکهای متابولومیکس و متابونومیکس به کمک اسپکتروسکوپی تشدید مغناطیس هسته (1h nmr) برای تعیین پروفایل متابولیک پروماستیگوتها و آماستیگوتهای اکسنیک گونه های متفاوت لیشمانیا به کار گرفته می شود. این روش نوین جهت نقشه متابولیتی گونه های پروماستیگوتهای لیشمانیا دنوانی بکار گرفته شده و می تواند در شناسایی گونه های مناسب تکنیک موفقی باشد. آنالیز پروفایل متابولوم می تواند تغییرات متابولیسم را که از تغییرات بازدهی متابولیت مشتق می شود، مشخص سازد و نیز در تعیین متابولیتهای جدید و مسیرهای موجود در این ارگانیسمها کمک شایانی نماید. شناسایی متابولوم واسطه ای این فازهای پارازیتی می تواند به تعیین متابولیت یا متابولیتهای منحصر بفرد هر مرحله به عنوان تارگتهای اختصاصی جهت درمان مورد استفاده قرار گیرد. در این مطالعه سعی بر این است که با استفاده از طیف سنجی1h nmr و نیز به کمک تکنیک های جدا سازی متابولیت های قطبی از سلول های کشت داده شده انگل لیشمانیا، پروفایل متابولیکی این انگل را در دو فاز لگاریتمی و ایستایی بدست آوریم و همچنین با استفاده از روش های "اصلی آنالیز اجزائی"(principal component analysis) و "حداقل مربعات جزئی" partial least squares)) داده های بدست آمده را مورد مقایسه قرار دهیم.

هدف از پژوهش کنونی بررسی اثر کیس پپتین-10 بر تراوش هورمون لوتئینه کننده (lh) در بزهای ماده آنستروس بود. آزمایش با استفاده از 5 ماده بز (5-4 ساله) در فصل آنستروس انجام شد. گامه آنستروس با اندازه گیری پروژسترون 10 و 20 روز قبل از تزریق کیس پپتین تایید شد. پنج بز، یک تزریق درون سیاهرگی سالین (2 میلی لیتر) به عنوان گروه کنترل دریافت کردند و همان بزها یک ساعت بعد کیس پپتین (1 میکروگرم بر کیلوگرم) به عنوان گروه تیمار دریافت کردند. نمونه های خون در زمان های 60-، 40-، 20-، 0 (درست قبل از تزریق)، 10، 20، 30، 40، 50، 60، 80، 100، 120 و 140 دقیقه پس از تزریق جمع آوری شدند و غلظت lh سرم اندازه گیری شد. این آزمایش در قالب طرح کاملا تصادفی اجرا شد و داده ها با رویه mixed، آنالیز شدند. تزریق 1 میکروگرم بر کیلوگرم کیس پپتین-10 اثری بر تحریک آزادسازی lh در بزهای ماده آنستروس نداشت.

مقدمه: لیشمانیا ماژور سوش فردلین( mhom/il/81/friedlin ) یکی از عوامل بیماری لیشمانیازیس پوستی می باشد. سیر زندگی انگل به دو فاز اصلی پروماستیگوت (تاژکدار) و آماستیگوت (بدون تاژک) تقسیم می شود. فاز پروماستیگوت نیز به دو مرحله پروماسیکلیک (غیر بیماری زا) و متاسیکلیک (بیماری زا) تقسیم می گردد. متاسیکلوژنسیس نقطه عطف تغییر شکل از فرم پروسایکلیک به متاسیکلیک است که با تغییرات عمده داخل سلولی همراه است و مسئول بیماری زا شدن انگل می باشد. علم متابولومیکس با استفاده از علوم بیوشیمیایی و بیوانفورماتیک به پروفایل نمودن تمام تغییرات متابولولیکی متاسیکلوژنسیس پرداخته است. این علم واکنش های داخل سلولی, تغییرات متابولیت ها ,پروفایلینگ فرآیندهای شیمیایی, آنالیز میکروبیوملکول هایی که تمام روابط داخل سلولی و خارج سلولی را کنترل می کنند بررسی می کند. مواد و روشها: لیشمانیا ماژور سوش فردلین در محیط آزمایشگاه در هر دو فاز کشت داده شد. نمونه ها در هر فاز شامل 1×109 انگل بودند که با استفاده از روش آگلوتیناسیون پینات از هم جدا شدند. بعد از عصاره گیری, نمونه ها لیوفیلیزه شدند تا برای اسپکتروسکوپی nmr آماده گردند. پودر لیوفیلیزه با 0.1 میلی لیتر از d2o دوباره بصورت محلول در آمده, سپس با دور 45000 g بمدت 20 دقیقه سانتریفیوژ گردید. مقدار 20µl از 4و4- دی متیل-4-سیلاپنتان-1-سولفونیک اسید(dss) با غلظت 1mm بعنوان مرجع به نمونه اضافه گردید. نمونه در دستگاه اسپکترومتر bruker av 400 nmr با گرادیان عملکردی 400.13mhz برای مشاهده پروتون در 298k با پروتکل noesy قرار داده شد. طیف ها برای اصلاح خط پایه, نرمالیزاسیونpareto با فواصل 0.004 پردازش شدند. pca و pls_da برای دسته بندی داده های هر دو فاز استفاده گردید. جابجایی های شیمیایی طیف ها با لودینگ پلات pls_da و دسته بندی نتایج با q2 اشان ارزیابی گردیدند. تغییرات مهم و عمده مشاهده شده در این پردازش های آماری با پایگاه داده ها و مسیرهای متابولیکی مقایسه گردیدند. بحث و نتیجه گیری: نتایج نشان دادند که متابولیسم اسیدهای آمینه, بخصوص شاخه دارها و متابولیسم کربوهیدراتها بخصوص گلوکونئوژنز بیشترین تغییرات را داشتند. گلیکولیز و سنتز پروتئین ها نیز تغییراتی داشتند. این نوع از انگل بسیار هوشمند بوده و بنا به تغییر وضعیت محیط, خود را با شرایط جدید وفق داده و از امکانات در دسترس برای بقا استفاده می کند. از یافته ها, این نتیجه حاصل می شود که در زمان تغییر انگل از فاز لگاریتمی به ایستایی, منبع تامین انرژی انگل از محل کربوهیدراتها به اسیدهای آمینه تغییر می یابد. کلید واژه: لیشمانیا, لیشمانیازیس, متابولومیکس,pca , nmr

مالاریا یکی از بیماری های مهم انگلی در کشورهای گرمسیری دنیا است. پلاسمودیوم فالسیپاروم انگل تک یاخته ای است که تب سه یک بدخیم را ایجاد می کند. آنتی ژن های پلاسمودیوم فالسیپاروم در سطح انگل یا در سطح سلول های آلوده ،کاندیداهای عمده جهت تولید واکسن می باشند، مانند: msp 1 و msp2 . کربوهیدرات های متصل به پروتئین های انگل مالاریا بعنوان اپی توپ های آنتی ژنیک مطرح بوده و بوسیله سیستم ایمنی میزبان تشخیص داده می شوند. بنابراین تصمیم به تخلیص آنتی ژنc-terminal msp1-19 و بررسی گلیکوزیلاسیون آن گرفته شد. انگل پلاسمودیوم فالسیپاروم در خارج از بدن میزبان و در شرایط in vitro با استفاده از روش trager and jensen کشت داده شد و با استفاده از روش raadfar میزان پارازیتمی تا 80% افزایش یافت. سپس سلول های انگل با بافر tkm مخلوط و اولترا سانتریفیوژ شدند. بدین ترتیب آنتی ژن های انگل پلاسمودیوم فالسیپاروم جدا و با روش sds-page الکتروفورز شدند.سپس با استفاده از ژل هایpreparative و روش الکتروالیوشن آنتی ژن مورد نظر تخلیص و با لوله های مخصوص تغلیظ شد، سپس الکتروفورز انجام شد و با رنگ آمیزی نیترات نقره رنگ و ایمونو بلاتینگ مورد بررسی قرار گرفت. آنتی ژن تخلیص شده بعد از رنگ آمیزی نیترات نقره و در روش ایمونوبلاتینگ تنها یک باند 19 کیلو دالتونی ایجاد نمود. بررسی گلیکوپروتئین ها با استفاده از کیت های qproteome o-glycan kit و qproteome total kit انجام شد و احتمال وجود گالاکتوز، n- استیل نورامینیک اسید (اسید سیالیک)، n- گالاکتوز آمین، گالاکتوز، n- گلوکز آمین، ساختارهای?- مانوزیدی شاخه دار و فرمهای هیبرید، پرمانوز در آنتی ژنc-terminal msp1-19 مشخص شد. تا کنون واکسنهای نوترکیب قادر به ایجاد ایمنی موثر و مطلوب نبوده و این امر ممکن است بدلیل عدم وجود گلیکوزیلاسیون مناسب باشد.

چکیده انگل لیشمانیا متعلق به خانواده تریپانوزوماتید می باشد که به دو فرم اصلی آماستیگوتی (بدون تاژک در بدن مهره دار) و پروماستیگوتی (تاژک دار در بدن پشه خاکی ) وجود دارد ،این انگل عامل بیماری لیشمانیوز بوده که از طریق نیش پشه خاکی جنس فلبوتوموس (د نیای قدیم) ولوتزمیا ( دنیای جدید) به انسان انتقال می یابد . بیماری لیشمانیوز یک بیماری کشنده جهانی است ودر مناطق گرمسیر دنیا شیوع دارد. فرمهای بالینی این بیماری عبارتند از : لیشمانیوز جلدی ، جلدی – مخاطی ، احشایی و کالازار پوستی پیشرفته . سالانه قریب به 500000 مورد جدید از لیشمانیوز احشایی از بخشهای مختلف دنیا گزارشده و سرعت شیوع آن در حال افزایش است، در ایران نیزاین بیماری در مشکین شهرآذربایجان وشهر بافت کرمان دیده شده است که عامل آن لیشمانیا اینفانتوم می باشد. .با توجه به عدم وجود واکسن وبروز مقاومت های دارویی مختلف انگل لیشمانیا ، استفاده از روش های نوین همچون علم متابولومیکس وتکنیک های پیشرفته نظیر طیف سنجی nmr به منظور شناسایی تغییرات متابولیت ها ومسیرهای بیوشیمیایی ضرورت می یابد. علم متابولومیکس به بررسی متابولیت ها در بافت و مایعات بدن می پردازد، در واقع این علم متابولیتهایی با وزن مولکولی کمتر از 1500 دالتون و محصولات متابولیکی فعال در مسیر های بیوشیمیایی سلول را تعیین وازنظر کمی وکیفی اندازه گیری می نماید. انگل لیشمانیا در طول چرخه زندگی خود دو فاز لگاریتمی و ایستایی را تجربه می نماید که متابولیت ها در این دو فاز با یکدیگر متفاوت هستند. در این مطالعه انگل لیشمانیا اینفانتوم به طور وسیع کشت داده شد ، پروفایل متابولیت های انگل به وسیله روش اسید پرکلریک و سونیکیت در دوفازتعیین ومقایسه گردید، طیف سنجی nmr با دستگاه بروکر mhz 400 انجام شد و fid های حاصله به کمک روش های کمومتریکس و pca و pls-da ونیزپایگاه اطلاعات متابولوم انسانی و متابولوآنالیز مورد ارزیابی قرا ر گرفت و تغییرات مسیرهای بیوشیمیای دو فاز شناسایی شد.مهمترین مسیرهای متابولیکی که دستخوش تغییر شده اند عبارت بود از : متابولیسم اسیدهای آمینه (بتا-آلانین ، والین ، لوسین وایزولوسین ، متیونین و ترئونین ) و متابولیسم کربوهیدرات (نشاسته و ساکارز) .شناسایی این متابولیت ها در فازهای مختلف انگل ونقش موثر آنها در مسیرهای متابولیسمی در تامین انرژی انگل ، می تواند ما را در دستیابی به متابولیت های منحصر به فرد به عنوان تارگت های اختصاصی جهت درمان وهمچنین کشف واکسن وداروهای جدید یاری رساند.

بیان موضوع: بیماریهای متابولیسمی مادرزادی گروه کمیابی از بیماریهای ژنتیکی هستند که چنانچه تشخیص و درمان نشوند می توانند پیامدهای بالینی جدی را بدنبال داشته باشند. این اختلالات سبب عقب ماندگی ذهنی، ناتوانیهای فیزیکی،آسیب های عصبی وحتی مرگ ومیرمی شوند که شایع ترین بیماری متابولیکی درایران بیمار ی فنیل کتونوری ((pku می باشد که از هر 10 هزار تولد در جهان، یک نوزاد به بیماری متابولیک فنیل کتونوریا مبتلا است در حالی که در کشور ما از هر 4000 تولد یک نفر دچار این بیماری می باشد و سالانه 300 تا 400 کودک مبتلا به pku درکشور متولد می شود. روش های نوین در تشخیص این گروه بیماری استفاده از اسپکتروسکوپی جرمی (lc/ms) و یا تشدید مغناطیس هستهnmr)) می باشد. متابولومیکس علم نوپدید پست ژنومیکس می باشد که به کمک آن می توان پروفایل متابولوم یک سیستم را در رابطه با عوامل بیماریزا مانند عوامل ژنتیک و یا پاتوژنیک مورد مطالعه قرار داد و به مارکرهای اختصاصی بیماری ها دست یافت. در این مطالعه پروفایل متابولوم بیماری pku به کمک دستگاه تشدید مغناطیس هسته مورد مطالعه قرار گرفته است. روش تحقیق: در این تحقیق20 نمونه ادرار از کودکان مبتلا به فنیل کتونوری و20 نمونه ادرار از کودکان سالم 4-2 ساله جمع آوری گردید. سپس با استفاده از اسپکتروسکوپی nmr و با پروتکل nosy به بررسی و تجزیه و تحلیل نمونه های ادرار جمع آوری شده پرداختیم . هدف: شناسایی بیومارکرهای موجود در ادرار کودکان مبتلا به بیماری فنیل کتونوری برای تشخیص سریع، آسان و کم هزینه بیماری می باشد. تشخیص سریع و به موقع بیماری باعث جلوگیری از بروز عواقب و خیم در کودکان مبتلا شده و همچنین سبب افزایش امید به زندگی در آنها می شود. نتیجه: در این تحقیق طیف های بدست آمده از نمونه های ادرار بیماران با نمونه های سالم در کمیکال شیفت 9-6 با یکدیگر مقایسه گردیده و متابولیتهای آلانین، فنیل آلانین و هیدروکسی فنیل استات که دچار تغییر شده بودند مشخص گردیدند.

معرفی : سرطان پروستات یکی از شایع ترین سرطان ها در بین مردان می باشد که بعد از سرطان ریه، دومین عامل مرگ و میر در بین مردان جامعه میباشد. این بیماری از غده پروستات شروع شده و سپس در مراحل بعدی می تواند به غدد لنفاوی و دیگر نقاط بدن متاستاز یابد. درمان موفق سرطان پروستات منوط به تشخیص زودهنگام سرطان در مراحل اولیه و جلوگیری از انتشار آن به غدد لنفاوی و دیگر بافت های بدن میباشد. متابولومیکس یکی از روش های نوین در تشخیص زودهنگام بیماریهاست. در این تحقیق با استفاده از روش اسپکتروسکوپی nmr که یکی از ابزارهای متابولومیکس است به بررسی پروفایل متابولیکی بیماران سرطان پروستات و مقایسه آن با افراد سالم خواهیم پرداخت. هدف : شناسایی پروفایل متابولیکی بیماران مبتلا به سرطان پروستات و مشخص نمودن بیومارکر یا متابولیت های چند گانه ، به منظور تشخیص زودهنگام و کم هزینه سرطان پروستات. روش کار : در این تحقیق ،15 نمونه سرم خون مردان مبتلا به سرطان پروستات، و 15 نمونه سرم خون مرد سالم جمع آوری شد و با استفاده از اسپکتروسکوپی h nmr و پروتکل cpmg به تحلیل و بررسی طیف های مربوطه و متابولیت های بدست آمده با استفاده از روشهای آماری چند متغیره و مدلسازی شبکه عصبی مصنوعی و منحنی roc پرداختیم. نتیجه : بررسی و تحلیل طیف های مربوطه، تفاوت های مسیر های متابولیسمی و متابولیت ها را در دو گروه سالم و بیمار مشخص کرد . میزان حساسیت تشخیص با استفاده از شبکه عصبی 85 درصد برای افراد نرمال و 57 درصد برای افراد سرطانی بدست آمد.همچنین با استفاده از این روش میزان خطای تشخیصی 15 درصد منفی کاذب و 43 درصد مثبت کاذب بدست آمد. میزان حساسیت تشخیصی با استفاده از تست roc برابر 83 درصد، در صورت گرفتن 100 متابولیت بعنوان بیومارکر محاسبه شد. با استفاده از این اطلاعات و روشهای مدلسازی شبکه عصبی مصنوعی و آنالیز منحنی roc مربوطه، می توان در تشخیص زود هنگام سرطان پروستات ، از این روش بهره گرفت .

سندرم متابولیک نوعی اختلال است که عموما با چاقی شکمی ،پرفشاری خون، دیس لیپیدمی و تست تحمل گلوکوز غیر طبیعی همراه است.این سندرم میتواند نشانه پیش آگهی بیماریهای کشنده ای همچون بیماریهای قلبی وعروقی ودیابت تلقی گردد.مطالعه حاضر جستجوی متابولیتهای حاصل مسیرها بیوشیمیایی درگیر در این بیماری رابا روش متابولومیکس ومتابونومیکس بررسی می نماید . امروزه تکنیکهای متابولومیکس و متابونومیکس به کمک اسپکتروسکوپی تشدید مغناطیس هسته( h nmr) برای تعیین پروفایل متابولیک بیماریها به کار گرفته می شود.این روش نوین جهت تعیین نقشه متابولیتی سندرم متابولیک بکار گرفته شدهاست،و می تواند در شناسایی بیماری در انسان تکنیک موفقی باشد.آنالیز پروفایل متابولوم می تواند تغییرات حاصل از چرخه های متابولیسمی را نشان دهد و نیز در تعیین متابولیتهای جدید و مسیرهای موجود در این سندرم کمک شایانی نماید. شناسایی متابولوم واسطه ای مسیرهای بیوشیمیایی می تواند به تعیین متابولیت یا متابولیتهای منحصر بفرد هر مرحله به عنوان تارگتهای اختصاصی جهت تشخیص مورد استفاده قرار گیرد. در این مطالعه سعی بر این است که با استفاده از طیف سنجی h nmrونیز به کمک تکنیک های جدا سازی متابولیت های سرم بیماران ، پروفایل متابولیکی این بیماری را بدست آوریم . و همچنین با استفاده از روش های "اصلی آنالیز اجزائی"(principal component analysis) و "حداقل مربعات جزئی" ( partial least squares) داده های بدست آمده را مورد مقایسه قرار دهیم.

بیماری فنیل کتونوری یک اختلال متابولیسمی مادرزادی است که به صورت اتوزومال مغلوب منتقل می شود. این بیماری به علت نقص آنزیمی جهت متابولیسم اسید آمینه ی فنیل آلانین ایجاد می شود و باعث تجمع مقادیر سمی از این اسید آمینه در بدن می گردد. شیوع این بیماری در ایران به علت میزان بالای ازدواج فامیلی بسیار بالاست. از آنجایی که در این بیماری، به ازای هر ماه 4 نمره از بهره ی هوشی نوزاد کم می شود، تشخیص زود هنگام این بیماری برای جلوگیری از پیشرفت آن بسیار حائز اهمیت می باشد. روش های متداول تشخیصی کنونی بر پایه ی تست گاتری و تأیید به روش hplc می باشد. متابولومیکس بر پایه ی nmr، برای آنالیز سریع نمونه های بیولوژیکی مناسب بوده و روش اسپکتروسکوپی 1h-nmr نسبت به روش های دیگر آنالیز ارجحیت دارد، زیرا این روش تنها نیاز به مقداراندکی نمونه (بدون نیاز به پیش تیمار) برای انجام آنالیز دارد. روش تحقیق: برای انجام این تحقیق، 15 نمونه سرم خون نوزاد بیمار و 15 نمونه سرم خون نوزاد سالم جمع آوری شد و با استفاده از اسپکتروسکوپی h-nmr و پروتکل cpmg به تحلیل و بررسی طیف های مربوطه و متابولیت های بدست آمده با استفاده از روش های آماری چند متغیره و مدل سازی شبکه عصبی مصنوعی پرداختیم. هدف از این تحقیق شناسایی پروفایل متابولیکی موجود در سرم خون کودکان مبتلا به بیماری فنیل کتونوری و مشخص نمودن بیومارکرها و تشخیص سریع، آسان و کم هزینه بیماری می باشد. بدیهی است تشخیص زود هنگام این بیماری، تأثیر زیادی در کیفیت زندگی و روند بهبود این دسته از بیماران دارد. بررسی و تحلیل طیف های مربوطه، تفاوت مسیر های متابولیسمی و متابولیت ها را در دو گروه سالم و بیمار مشخص کرد که بیشترین تغییرات متابولیت ها در مسیرهای تریپتوفان، تیروزین و فنیل آلانین بود. میزان حساسیت تشخیص با استفاده از شبکه عصبی مصنوعی 75 درصد برای افراد نرمال و 43 درصد برای افراد فنیل کتونوری بدست آمد. همچنین با استفاده از این روش میزان خطای تشخیصی 40 درصد برای افراد نرمال و 40 درصد برای افراد بیمار محاسبه شد. با استفاده از این اطلاعات و روش های مدل سازی شبکه عصبی، می توان در تشخیص زودهنگام بیماری فنیل کتونوری از این روش بهره گرفت.

اهمیت بیماری مالاریا به خاطر شیوع زیاد و مرگ ومیر و مقاومت دارویی قابل توجه است. لذا تحقیقات جدیدی باید صورت بگیرد تا داروهای جدیدی با کارایی بالاتر عرضه شود. در این مطالعه از موش به عنوان حیوان بیمار شده با پلاسمودیوم برگی استفاده شد و اثربخشی داروهای ترکیبی ائوزین b و آرتمیزینین با دوزهای مختلف بر روی آن ها موردمطالعه قرار گرفت. هدف از این آزمایش به دست آوردن دوز پایین تر دارو با اثربخشی بیشتر با داروهای ترکیبی است. متابولومیکس به مطالعه ی هم زمان مولکول های کوچک یا متابولیت هایی می پردازد که در سلول، بافت یا یک ارگان جود دارند و در متابولیسم اولیه دخالت می نمایند. در میان تکنولوژی های موجود جهت آنالیز یک متابولوم اسپکتروسکوپی ms و 1hnmr عموما موردتوجه اند. با استفاده از متابولومیکس تغییرات متابولیکی در اثر داروها را می توان اندازه گرفت. جهت استخراج متابولیت های تغییریافتهی نمونه از دستگاه 1hnmr به روش cpmg در آزمایشگاه فیزیک دانشگاه اصفهان استفاده شد. با توجه به یافته های این تحقیق ترکیب دارویی mg/kg 5/1 آرتمیزینین و mg/kg 5 ائوزین b با کاهش معناداری در درصد پارازیتمی موش های مبتلا در سطح معنی داری 001/0>p موجب سرکوب بیماری در موش های balb/c گردیده که با تکرار آن در موش های cba/j مورد تأیید قرار گرفت. تغییرات متابولیکی اختصاصی در اثر داروی ترکیبی ائوزین b و آرتمیزینین methylhippuric acid، cholesterol بودند. تغییرات مسیرهای متابولیسمی اختصاصی در اثر داروی ترکیبی ائوزین b و آرتمیزینین در بیوسنتز استروئیدها و متابولیسم اسیدهای صفراوی اولیهبوده است.

بیماری لیشمانیازیس از جمله شش بیماری مهم منطقه حاره ای محسوب می گردد. اهمیت کنترل این بیماری، به دلیل افزایش موارد مقاومت دارویی مشاهده شده در بیماران می باشدوبا توجه به نیازمبرم به داروهای جدید با عوارض کمتربرای کنترل ودرمان بیماری، تاثیر داروی آرتمیزینین برروی متابولیت های پروماستیگوت های انگل لیشمانیا ماژور( سوش فردلین)در شرایط آزمایشگاهی در انستیتو پاستور تهران بررسی گردید.

بیماری سندرم تخمدان پلی کیستیک سال ها پیش شناخته شده است و برای آن راههای تشخیصی و درمانی بسیاری ارائه گردیده. اما بدلیل عوارض جسمی و روانی بسیاری که بر جای می گذارد بر آن شدیم که برای پیشگیری از عوارض متعدد آن در کنار آزمایشات هورمونی و اندازه گیری پارامترهایی چون لیپیدها از طریق طیف سنجی h1 nmr پروفایل متابولوم بیماری به ردیابی مارکرهای جدید جهت تشخیص زود هنگام بیمای بپردازیم.در این مطالعه نتایج حاصله نشانگر جداسازی متابولیتهای اختصاصی گردید که خود باعث تخشخیص زود هنگام بیماری گردیده و به کاهش عوارض بیماری می انجامد.

بیماری مولتیپل اسکلروزیس(ms) یک بیماری خود ایمنی مزمن و التهابی است که در آن سیستم ایمنی بدن به سیستم عصبی مرکزی حمله می کند. علائم این بیماری، شدت بروز آن و همچنین سیر بیماری از فردی به فرد دیگر متفاوت است. تشخیص بیماری ام اس به این دلیل که علائم و نشانه های مشابه دیگر بیماریها دارد دشوار است. متابولومیکس یکی از روش های نوین در تشخیص زود هنگام بیماری هاست. در تحقیق پیش رو با استفاده از روش اسپکتروسکوپی nmr که یکی از ابزارهای متابولومیکس و متابونومیکس است به بررسی پروفایل متابولیکی این بیماران و مقایسه آن با افراد سالم خواهیم پرداخت. با استفاده از طیف سنجی h1 -nmr طیف های اختصاصی که نشان دهنده متابولیت خاصی است، به دست می آید و به این روش می توان به بیومارکرهای اختصاصی بیماری دست یافت. هدف شناسایی پروفایل متابولیکی بیماران مبتلا به مولتیپل اسکلروزیس و مشخص نمودن بیومارکر به منظور تشخیص زودهنگام، آسان و کم هزینه مولتیپل اسکلروزی است.

سرطان به رشد بی رویه سلول های بدن گفته میشود. امروزه سرطان از عوامل اصلی مرگ و میر درجهان می باشد. آلوورا گیاهی دارویی بوده و استیله مانان و آلوئین ماده موثر آن دارای خواص ضد سرطانی است. متابونومیکس جهت تولید پروفایل نهایی متابولیکی در نمونه آزمایشی می تواند در پاسخ به درمان، مورد استفاده قرار گیرد. بررسی طیف سنجی (nmr) رویکرد مناسبی برای تعیین پروفایل متابولیکی نمونههای زیستی با استفاده از تکنیک های غیر تهاجمی برای ارزیابی نشانگرهای متابولیکی هستند. همچنین با استفاده از نرم افزارهای پیشرفته می توان الگوی متابولیتی و تغییرات پس از آن را بررسی نمود. ارزیابی اثر مهارکنندگی عصاره آلوورا بر روی سلول های سرطانی راجی و تعیین تغییرات متابولیت های سلول های سرطانی در مجاورت عصاره آلوورا انجام گرفت . برای عصاره گیری از گیاه آلوورا برگ ها را شسته و پوسته رویی و زیرین را با چاقو برداشته و سپس خرده کرده و با استفاده از تنظیف تمیز شیرابه از ژل جدا و لیوفیلیزه شد. کشت سلول های راجی (سلول های سرطانی لنفوما) در محیط rpmi انجام شد. پس از تعیین ic50 آن را جمع آوری کرده و سپس با استفاده از دستگاه 1hnmr طیف های دو گروه کنترل و گروه تیمار با دارو تعیین شد. ic50 در غلظت 44 میکروگرم/ میلی لیتر به مقدار 4 میکرولیتر عصاره آلوورا تعیین شد و همچنین تغییرات متابولیت های سلول های راجی در مجاورت شیرابه آلوورا مشاهده شد. بررسی طیف متابولیتی گروه کنترل و گروه تیمار شده با دارو، نشان دهنده تأثیر عصاره آلوورا بر روی سلول های راجی می باشد.

چکیده ندارد.