سامانه اطلاعات بیمارستانی سامانه ای رایانه ای است که از آن به عنوان ابزار الکترونیکی مدیریت اطلاعات بیمارستانی استفاده می شود و نقش مهمی در زمینه ی ارائه ی خدمات مراقبت سلامت باکیفیت ایفا می کند. با این همه سامانه اطلاعات بیمارستانی نسبت به سایر سامانه های اطلاعاتی صنعتی و تجاری در به کارگیری فناوری اطلاعاتی و استفاده از استانداردهای کیفیت برای رضایت مشتری عقب مانده است. نظر به اهمیت این مسئله، پژوهش حاضر برآن است با ارزیابی سامانه های اطلاعات بیمارستانی در بیمارستان های آموزشی وابسته به دانشگاه علوم پزشکی شیراز، نقاط ضعف و قوت این سامانه ها را شناسایی کرده و در جهت بهبود آن گام بردارد. روش تحقیق به کار رفته در این پژوهش، روش پیمایشی است. جامعه پژوهش، بیمارستان های آموزشی دانشگاه علوم پزشکی شیراز که مجهز به سامانه اطلاعات بیمارستانی بودند، می باشد. روش گردآوری داده ها، مصاحبه و مشاهده مستقیم می باشد. گردآوری داده ها با استفاده از سیاهه وارسی معیارهای کالج پزشکان آمریکا انجام شده است. تحلیل داده ها با استفاده از روش های آمار توصیفی صورت گرفته است. یافته ها نشان داد که، در بیمارستان های مورد مطالعه بخش آزمایشگاه با 5/43 درصد بیشترین تطابق و بخش مدارک پزشکی با 03/21 درصد کمترین تطابق را با معیارهای کالج پزشکان آمریکا دارند. همچنین بیمارستان فقیهی با 8/41درصد بیشترین و بیمارستان زینبیه با 2/25درصد کمترین انطباق را با معیارهای کالج پزشکان آمریکا دارند. در بخش داروخانه، مکانیسم ورود داده ها و ارائه گزارش دارای تطابق کامل و تداخلات دارویی هیچگونه تطابقی با معیارهای کالج پزشکان آمریکا ندارند. در بخش آزمایشگاه، مکانیسم ورود داده ها دارای تطابق کامل و نگهداری سابقه آزمایش دارای تطابق 5/87 درصدی می باشد. گزاره امکان دریافت اطلاعات از مراکز خارج از آزمایشگاه هیچگونه تطابقی با معیارهای کالج پزشکان آمریکا ندارد. در بخش رادیولوژی، مکانیسم ورود داده ها دارای تطابق کامل و نگهداری سابقه آزمایش دارای تطابق 5/87 درصدی می باشدو گزاره امکان انتقال اطلاعات از مراکز خارج از رادیولوژی دارای تطابق 25 درصدی می باشد. در بخش مدارک پزشکی، مکانیسم ورود داده ها دارای تطابق کامل و نیز ذخیره داده ها ، فرمت فایل ها و فرآیند تهیه نسخه پشتیبان دارای تطابق 75 درصدی می باشند و گزاره پشتیبانی یا ارتباط از طریق صفحه گسترده هیچگونه تطابقی با معیارهای کالج پزشکان آمریکا ندارند. میزان تطابق نهایی سامانه اطلاعات بیمارستانی بیمارستان های مورد مطالعه نشان می دهد که میانگین کل سامانه کمتر از 50 درصد و در حد ضعیف بوده است.