امروزه روش های مختلفی برای شناسایی وجود آلودگی به کلی فرم ها و اشریشیا کلی در آب وجود دارند که هرکدام دارای مزایا و معایبی نسبت به یکدیگر می باشد. در این میان روش چند لوله ای در مورد آب به-عنوان روش مرجع در ایران مورد تأیید می باشد (استانداردهای ملی ایران به شماره های 3759 و 7225). از مهم ترین معایب روش مرجع چند لوله ای نیاز به صرف وقت زیاد و انجام حجم عملیات بالای آزمایشگاهی است. به دلیل بالا رفتن نیاز به تأمین سریع و کافی آب سالم، روش های سریع با حساسیت بالا برای کنترل کیفیت و تأمین آب موردنیاز، از ضروریات صنایع تصفیه آب می باشد. از روش های جدید کنترل کیفی می توان به تکنیک های امپدانس و بهره گیری از محیط کشت فلوروژنیک اشاره نمود. از مزایای آن ها نسبت به روش مرجع، عدم نیازمندی به عملیات آزمایشگاهی با حجم بالا و سرعت نسبتاً زیاد آن ها در حصول نتایج می باشد. لذا با توجه به این موضوع، ارزیابی مقایسه ای نتایج حاصل از به کارگیری محیط های امپدانس،‏‏ فلوروژن و مرجع در کنترل کیفیت کلی فرمی و اشرشیا کلی در آب مدنظر قرار گرفت. بدین منظور در طی تحقیق حاضر بر روی 100 نمونه آب جمع آوری شده از مراکز مختلف شامل دامداری‏‏، مرغداری‏، کارخانه های صنایع غذایی و مراکز کشت و صنعت که آب مصرفی آن ها از شبکه آب رسانی شهری تأمین نمی شد، ارزیابی آلودگی به کلی فرم و اشرشیا کلی با استفاده از سه روش مرجع، امپدانس و فلوروژنیک انجام گرفت. بر اساس نتایج حاصله به ترتیب 65، 69 و 63 نمونه آب با استفاده از روش های مرجع، امپدانس و فلوروژنیک آلوده به کلی فرم تشخیص داده شدند. همچنین با استفاده از سه روش مذکور، آلودگی به اشرشیا کلی به ترتیب 36، 64 و 56 مورد در 100 نمونه آب موردبررسی بود. بررسی آماری با استفاده از نرم افزارspss 16 انجام گرفت. آزمون کوکران نشان داد که تفاوتی بین سه روش در تشخیص کلی فرم وجود ندارد (05/0< p). اما سه روش مورداستفاده در تشخیص اشرشیا کلی عملکرد یکسانی نداشته (001/0p<)، به طوری که روش امپدانس و فلوروژن با روش مرجع اختلاف معناداری دارند (001/0p<)، ولی هیچ اختلافی بین روش های امپدانس و فلوروژن وجود ندارد (05/0<p). با توجه به آنالیز آماری مطالعه صورت گرفته می توان از روش امپدانس و فلوروژنیک به جای روش مرجع برای شناسایی کلی فرم استفاده نمود اما برای شناسایی اشرشیا کلی نمیتوان استفاده کرد.