باکتری استافیلوکوکوس آرئوس از مهمترین عوامل عفونت های بیمارستانی و اکتسابی می باشد. این باکتری قدرت بیماری زایی بالایی دارد و بدلیل افزایش روز افزون مقاومت در برابر داروهای ضد میکروبی، این باکتری به یکی از مهم ترین مشکلات در سرتاسر جهان تبدیل شده است. به علت بالا بودن میزان مرگ و میر ناشی از عفونت های بیمارستانی سویه های استافیلوکوکوس آرئوس مقاوم به متی سیلین ، تعیین و آگاهی از الگوی منطقه ای مقاومت آنتی بیوتیکی به منظور راهنمایی مناسب جهت درمان عفونت های ایجاد شده به وسیله این ارگانیسم حائز اهمیت می باشد. از طرفی بررسی ژنوتیپی سویه های این باکتری به دلیل نقشی که در تمایز ایزوله ها دارد در ردیابی منشاء عفونت و کنترل آلودگی های ناشی از آن می تواند کاربرد فراوانی داشته باشد. روشهای مولکولی زیادی به منظور تعیین الگوی ژنی سویه های استافیلوکوکوس آرئوس ابداع شده اند. یکی از روش های پیشنهادی، بررسی ناحیه پلی مورفیسم ژن spa با روش pcr است. نواحی پلی مورفیسم x ژنspa یکی از عوامل متمایز کننده است و در مطالعات مختلف الگوهای متنوعی از این ژن شناسایی شده اند. بنابراین تعیین تیپ ایزوله های استافیلوکوکوس آرئوس با استفاده از ژن spaمی تواند روش مناسبی برای مطالعات اپیدمیولوژیکی باشد.