آلودگی آبهای زیر زمینی به نیترات یکی از مهمترین مشکلات زیست محیطی در برخی از نواحی دنیاست. منابع آلوده کنندهء آبهای زیر زمینی و سطحی به نیترات شامل منابع طبیعی و انسان ساخت است. به دلیل حلالیت بسیار بالای نیترات این ترکیب به آسانی به درون خاک و سفره های آب زیرزمینی نفوذ می کند. در مناطقی که دارای نرخ بارندگی کم و پوشش گیاهی ضعیف است، آلودگی آبها به نیترات چشمگیر تر است. اگر مقدار یون نیترات در آب آشامیدنی بیش از حد مجاز باشد، می تواند سبب بیماریهای متهموگلوبینا در کودکان، اختلال در تیرویید، گواتر، افزایش فشار خون و سرطان معده شود.