در این مطالعه به منظور شناسایی و جمع آوری عوامل سیاهکی، از گرامینه های اهلی و وحشی مزارع و مراتع آلوده به سیاهک در استان های اصفهان و چهار محال و بختیاری نمونه برداری انجام گردید و پس از شناسایی میزبان های آلوده در حد گونه، ویژگی های ریخت شناسی و جوانه زنی تلیوسپور گونه های سیاهک هر میزبان با دو میکروسکوپ نوری و فلورسنت مورد بررسی قرار گرفت. از آنجا که دو گونه tilletia controversa و tilletia caries از نظر مورفولوژیکی و ساختار ژنتیکی به قدری مشابهند که برخی آنها را یک گونه در نظر گرفته و آنها را موتانت یکدیگر می دانند، بررسی امکان تمایز آنها با استفاده از ژن های its, ef1-?, rpb2 هدف دیگر این پژوهش بود. بعد از استخراج dna ژنومی برای تکثیر جدایه ها از آغازگرهای) its(4,5، ef1(636,1567) ،rpb2(740, 1365) استفاده گردید. بررسی های انجام شده، امکان تمایز دقیق این دو گونه را فراهم نکرد. تجزیه واریانس مولکولی به اعضای تشکیل دهنده در مورد ژن rpb2 نشان داد این ناحیه ژنی نسبت به سایر نواحی مورد بررسی ، تنوع بالاتری بین افراد گونه ها دارد و در مقام مقایسه با سایر ژن های مورد بررسی، بهتر عمل می کند ولی ترکیب این نواحی تمایز بهتری را بین دو گونه قائل شد، طوری که افزایش قطعات تکثیر یافته توانست به صورت دقیق گونه های مورد نظر را از یکدیگر متمایز کند. محاسبات نشان داد افراد درون گونه t.controversa در ناحیه ژنی ef1-? و its متنوع تر از افراد گونه t.caries می باشند، ولی ژن rpb2 تنوع بالاتری در بین افراد گونه t.caries نشان داد.