امروزه به دلیل گسترش مبادلات تجاری منطقه ای و فرا منطقه ای، حمل و نقل کالا علی الخصوص حمل و نقل دریایی مورد توجه و اهمیت فراوان قرار گرفته و حمل و نقل کانتینری با سرعت فراوان رو به رشد می باشد به طوری که 90% از تجارتهای جهانی با حمل و نقل کانتینری می باشد. در حمل و نقل کالا از طریق کانتیر گروههای بسیاری درگیر می باشند، مهندسی مجدد یکی از روشهایی است که با بهبود فرایندها امکان کسب مزیت رقابتی را برای گروههای درگیر در این زنجیره فراهم می کند و با تحقق بخشیدن بهره وری و اثر بخشی در فرایندها امکان سرویس دهی مناسب و سریع به مشتریان را فراهم می نماید. در این تحقیق پس شناسایی زنجیره عرضه حمل و نفل کانتیری و گروههای درگیر در آن، زنجیره ارزش حمل و زنجیره ارزش تامین و پشتیبانی کانتیر مورد بررسی قرار گرفتند و سپس مشکلات فرایندی در این فرایندها بررسی شدند که برای شناسایی مشکلات از الگوی شناسایی مشکلات استفاده شده است که این الگو مشکلات فرایندها را در شش گروه اصلی، مشکلات مربوط به جریان و روند کار، مشکلات مربوط به مدیریت روزانه، مشکلات مربوط به خروجی فرایند، مشکلات مربوط به ورودی فرایند، مشکلات مربوط به کنترلها و مشکلات مربوط به تواناسازها دسته بندی می نماید.