اولین مرحله ساخت یک سازه زیرزمینی، طراحی آن است. به طور کلی طراحی، یعنی پیش بینی کلیه مسائل و مشکلاتی که در جریان احداث یک سازه پیش خواهد آمد، و در نهایت ارائه راه حلی برای غلبه بر این مشکلات و تعیین برنامه ای که سازه مورد نظر با رعایت جنبه های اقتصادی و ایمنی بتواند اهداف کاربر را در مدت زمان مورد نظر تامین کند. با وقوع روانگرایی و زائل شدن مقاومت برشی خاک، نشست های بسیار بزرگی به پی سطحی ساختمان تحمیل می شود که می تواند منجر به آسیب دیدگی جدی سازه و عناصر غیر سازه ای بنایی نهایتا تخریب آن گردد. روش های عددی و روش های مبتنی بر مشاهدات و اندازه گیری با ابزار دقیق، دو راه عمومی برای پیش بینی نشست های سطحی ناشی از گودبرداری می باشند. اکثر فرمول ها و روابط کلی که برای تخمین نشست ارائه شده اساسا مبتنی بر تئوری و تجربه بوده و روش های عددی عمدتا در مطالعات موردی به کار رفته اند. برای بررسی میزان جابه جایی سطح زمین در اثر گود برداری پروژه برج دانشگاه مشهد از نرم افزار اجزای محدودplaxis استفاده می گردد. این برنامه از امکانات گرافیکی ساده ای استفاده می کند تا کاربر را قادر به ایجاد مدل ژئوتکنیکی و مش بندی المان محدود نماید.