چکیده خشکی یکی از مهمترین عوامل ایجادکننده تنش غیر زیستی در گیاه محسوب می شود. گندم به عنوان یک گیاه زراعی مهم ، اغلب در مناطقی کشت می شود که حداقل در دوره ای از سال با کم آبی مواجه می شود. یکی از راهکارهای شناسایی پروتئین های درگیر، در راستای بهبود تحمل گیاه به تنش کمبودآب، پروتئومیک است که از نتایج آن می توان برای افزایش عملکرد گندم استفاده کرد. به منظور بررسی اثر تنش کمبودآب بر الگوی پروتئوم ریشه گندم رقم متحمل کویر، آزمایشی بصورت تکراردار و با هفت تکرار انجام شد. استخراج پروتئین های ریشه به روش tca/ استون انجام شد و الگوی بیان پروتئینی با استفاده از الکتروفورز دوبعدی بررسی گردید. پروتئین های احتمالی درگیر در تنش کمبودآب با مقایسه الگوی بیان تحت تنش کمبودآب با الگوی بیان در آبیاری عادی شناسایی شد. نتایج نشان داد اختلاف بین تیمارها برای صفات وزن تر ریشه و طول ریشه در سطح احتمال 5% معنی دار و برای صفات وزن خشک ریشه، وزن خشک اندام هوایی و وزن تر اندام هوایی در سطح احتمال 5% غیر معنی دار است. بررسی الگوی بیان پروتئوم ریشه 98 لکه پروتئینی تکرارپذیر را نشان داد که از میان آنها 10 لکه از لحاظ آماری دارای اختلاف بیان معنی دار بودند که هشت لکه افزایش بیان و یک لکه کاهش بیان نشان دادند. این لکه های پروتئینی براساس وزن مولکولی (mw) و نقطه ایزوالکتریک pi) (با جستجو در بانک های اطلاعاتی مورد شناسایی قرار گرفتند. پروتئین های پاسخ دهنده به تنش در گروه های عملکردی مختلف قرار دارند. این گروه ها شامل »سنتز و تجمع پروتئین« ،» تنش اکسایشی « ،» پاسخ و دفاع در برابر تنش « و »مسیرهای متابولیکی «بودند.