در این پروژه هدف طراحی و ساخت fluorescence detection systemجهت آشکارسازی مولکول های dna می باشد. در روش pcr، طی چندین چرخه دمایی، مولکول های dna کپی می شوند و سپس با استفاده از روش fluorescence detection، مولکول های بر انگیخته شده dna آشکارسازی می شوند. پس از آشکارسازی می توان به کپی و یا عدم کپی dnaها پی برد.می توان برای جداسازی مولکول های dna بر اساس طولشان، از روش gel electrophoresis استفاده کرد.جهت آشکارسازی مولکول هایdna، از مواد فلورسنت استفاده شده است. به دلیل دقت کافی اتیدیم بروماید (etbr)، این ماده به عنوان ماده فلورسنت انتخاب شد.با توجه به حرکت مولکول های dna در طول ژل و اسکن مداوم عرض ژل، در نهایت می توان تصویری دو بعدی از میزان جابجایی مولکول هایdna در ژل چاپ کردکه این تصویر بیانگر اطلاعات ساختار dna ها، می باشد.