یکی از روش های مفید بررسی عبور حلال ها از نانوکانال ها شبیه سازی دینامیک مولکولی می باشد.. این شبیه سازی به منظور مطالعه مکانیسم عبور حلال ها و امکان جداسازی آلاینده های آلی از آب انجام شد. این آلاینده ها که عمدتا به صورت حلال استفاده می شوند مانند دی متیل سولفوکسید و استون و مخلوطی از هر دو ابتدا به صورت خالص و سپس به صورت مخلوط با آب مطالعه و شبیه سازی شد.