از آنجا که جامعه اسلامی با چالش ها و بحران های پیچیده و بیشتری نسبت به سایر جوامع مواجه است، بعد از آغاز رهبری حضرت آیت الله خامنه ای، تا به حال جامعه اسلامی ایران نیز با چالش ها و مشکلات مختلفی روبرو شد که مطالعه نحوه مدیریت و رهبری معظم له در این شرایط بسیار حائز اهمیت است. لذا در این پژوهش کوشیده ایم نقش رهبری حضرت آیت الله خامنه ای در حل چالش های سیاسی جمهوری اسلامی ایران در مقطع تاریخی (90-84) بررسی نماییم. از این رو، ابتدا به چالش های مهمی که در طی مقطع مورد نظر اتفاق افتاده چه به لحاظ؛ نظری و چه به لحاظ عملی در دو حوزه داخل و خارج، سپس به بررسی دیدگاه ها و مدیریت عملی مقام معظم رهبری پرداخته ایم و در نهایت، نقش رهبری معظم له در حل چالش های سیاسی جمهوری اسلامی ایران در مقطع تاریخی (90-84) را بیان نموده ایم. پرسش اصلی تحقیق حاضر این است که نقش رهبری حضرت آیت الله خامنه ای درحل چالش های سیاسی جمهوری اسلامی ایران در مقطع تاریخی (90-84) چگونه بوده است؟ فرضیه اصلی این تحقیق بر این مبنا شکل گرفته است که حضرت آیت الله خامنه ای به عنوان رهبر نظام اسلامی با سعی بلیغ و همت مضاعف و تجارب و توانمندی های هوشمندانه خود و بکار بستن استانداردهای علمی مدیریت و رهبری، برای رفع چالش های نظری و عملی جامعه اسلامی ایران توانسته اند در تبیین مولفه های انقلاب و خط امام خمینی(ره)، در پیوند نوین دین و سیاست امورکشور را هدایت و رهبری نماید و بخشی را که پارامترهای لیبرالی و یا ملی گرایانه در اندیشه هایشان نمود یافته و دچار التقاط گشته بود را به حاشیه برانند. لذا با تحلیل این چالش ها و همچنین مدیریت مقام معظم رهبری به این نتایج رسیده ایم که؛ این رهبری در پیشبرد اهداف جهانی اسلام و انقلاب اسلامی و تحقق آرمان های امام امت(ره) بنحو بسیار شایسته رقم خورده است بگونه ای که علاوه بر تأمین اهداف نظام در حد مطلوبی اقتدار و عزت جهانی ملت ایران تأمین گردیده و مهمتر اینکه این سیاست ها و راهبردهای جهانی و منطقه ای استکبار جهانی را با ناکامی و شکست مواجه کرده است. بعنوان نمونه؛ شکست آنان در تأمین امنیت رژیم صهیونیستی، چپاول و استثمار ملت های مسلمان، ناکامی اهداف آنها در اشغال افغانستان و عراق و شکست آشکارشان در اجرای سیاست انقلاب مخملی و بر اندازی آرام و فروپاشی اجتماعی در قبال انقلاب اسلامی ایران (فتنه 88) از این جمله اند. و در حوزه داخل نیز نشاط و سربلندی، پیشرفت های همه جانبه، عزّت و اقتدار ملی و بین المللی نظام، بهترین گواه بر حسن این تدبیرها و حیرت مستکبران عالم و مجبور به اعتراف شدن آنان مبنی بر اینکه؛ تا زمانی که سید علی خامنه ای رهبر ایران هست مردم ایران به پیشرفت خود ادامه داده و این انقلاب از بین رفتنی نیست. خود گواه بر این است که ایشان توانسته اند در حل این چالش ها و معظلات و مشکلات بوجود آمده با همه ابعاد و حوزه های آن فائق آید.