مقاومت میزبانی و غیر میزبانی دو نوع از مقاومت گیاهان در برابر عوامل بیماری زا هستند. برای پی بردن به این که چقدر ماهیت ژن های دخیل در این دو نوع مقاومت از هم متمایز می باشد، یکی از راه های پیش رو استفاده از آنالیز عملکردی qtl های مکان یابی شده برای دو نوع مقاومت می باشد. برای این منظور،qtl های مرتبط با مقاومت که حاصل مطالعات قبلی بود از منابع استخراج شد.و با استفاده ازنشانگرهای snp، برای بررسی هم وقوعی نشانگرهای شاخص مرتبط با هر یک از qtl ها با نشانگرهای snp ، استفاده شد. نشانگرهای snp دارای هم-وقوعی بالا به عنوان نشانگر مرتبط با مقاومت انتخاب و با استفاده از مطالعات بیوانفورماتیکی به بررسی عملکرد آن ها پرداخته شد. بررسی عملکرد ژن ها از نظر دمین های حفاظت شده نشان داد که بیشتر ژن های مقاومت غیر میزبانی و میزبانی در فعالیت انتقال، هدایت پیام و رونویسی dna مشارکت دارند. بررسی هستی شناسی ژن ها نشان داد که عملکرد بیشتر ژن های مقاومت میزبانی و غیر میزبانی رفتار مشابهی دارند. این تحقیق نشان داد که علاوه بر مکانیسم، احتمالا ژنتیک دو نوع مقاومت میزبانی وغیر میزبانی دارای تشابهات زیادی می باشد.