بسیاری از عملکردهای rna به تعاملات بین rna و پروتئین ها وابسته است چنانکه درک مکانیزم مولکولی تعاملات rna و پروتئین یکی از مباحث اصلی در علم بیوانفورماتیک به شمار می رود. تعاملات پروتئین و rna نقش مهمی در گستره ی وسیعی از فرآیندهای مختلف سلولی از جمله پیوند و ساخت پروتئین، بیان ژن، پردازش rna، مکانیزم دفاع سلولی و تنظیم رونویسی در بیان ژن جهت مقابله با عوامل بیماری زا دارند. روش های آزمایشگاهی با توان عملیاتی بالا برای تشخیص تعاملات پروتئین و rna ایجاد شده اند، اما بسیار زمانبر و پر هزینه هستند. از اینرو روش های محاسباتی برای پیشگویی تعاملات پروتئین و rna نیاز می باشد. در این تحقیق دو روش به منظور پیشگویی تعامل یا عدم تعامل بین پروتئین و rna تنها با استفاده از اطلاعات مربوط به توالی ارائه شده است. توالی پروتئین و rna به عنوان ورودی در نظر گرفته می شود و متد تشخیص می دهد که این دو با یکدیگر تعامل دارند یا خیر. بدلیل ماهیت مسئله فیچرهای استخراج شده از توالی پروتئین و rna را بصورت ترکیب تمامی حالات ممکن حاصل از ویژگی های استخراج شده در نظر گرفته شده است تا مجموعه ی بهتری از ویژگی ها برای آموزش فراهم شده و بهترین نتیجه ممکن برای پیشگویی حاصل شود.