در این تحقیق، از روش ژنوتایپینگ انتخابی برای مطالعه ارتباط سه ژن کاندیدا (gnrhr، lhr و fshr) با برخی از صفات تولید مثلی در گاو های هلشتاین استفاده شد. انتخاب حیوانات بر مبنای ارزش های انتهایی باقی مانده صفت روز های باز با استفاده از مدل مختلط انجام شد. 200 گاو، متشکل از 100 گاو با مقادیر باقی مانده کم تر از میانه و 100 گاو با مقادیر باقی مانده بزرگ تر از میانه انتخاب شدند. استخراج dna از نمونه های خون به روش نمکی بهینه یافته و واکنش زنجیره ای پلی مراز (pcr) برای تکثیر قطعات 220، 303 و 306 جفت بازی به ترتیب از ناحیه اگزون های 2، 11 و 10 ژن های gnrhr، lhr و fshr با استفاده از آغاز گر های اختصاصی انجام شد. شناسایی فرم های مختلف آللی در هر سه ژن با استفاده از روش چند شکلی زنجیره ای تک رشته ای انجام شد. تمامی نمونه ها در جایگاه ژنی gnrhr مونومورف، اما در دو جایگاه نشانگری lhr و fshr چند شکلی مشاهده شد. ارتباط بین فراوانی های آللی و ژنوتیپی و گروه بندی صفات با استفاده از آزمون های فیشر و کوکران – آرمیتاژ، و ارتباط صفات مورد نظر و ژن های مورد مطالعه از طریق تجزیه واریانس با استفاده از مدل رگرسیونی و آنالیز تابعیت لجستیک برآورد شد. مقایسه فراوانی ژنوتیپی با آزمون فیشر بین ژنوتیپ های جایگاه lhr نشان داد که ژنوتیپ bb با تعداد روز های باز، فاصله زایش و وزن تولد کم تر ارتباط معنادار داشت (05/0>p)، اما جایگاه نشانگرfshr برای هیچ یک از صفات مورد مطالعه، اختلاف معناداری نشان نداد. نتایج حاصل از آزمون رگرسیون و هم چنین مدل تابعیت لجستیک زمانی که مقایسه بین هتروزیگوت ها در مقابل هر یک از هموزیگوت های مربوطه در هر یک از جایگاه های نشانگری در نظر گرفته شد، با هیچ یک از صفات مورد مطالعه، معنادار نشدند (05/0<p).