هلیکوباکترپیلوری عامل بیماری هایی مانند گاستریت، زخم ها ی گوارشی، سرطان معده و لنفوم malt است.در سال 1994 هلیکوباکترپیلوری به عنوان کارسینوژن کلاس یک شناسایی شد و اکنون به عنوان رایج ترین عامل سرطان های مرتبط با عفونت محسوب می شود و 5/5درصد از کل سرطان در جهان را در بر می گیرد. در ایران تعداد قابل ملاحظه ای ازافراد آلوده به عفونت هلیکوباکترپیلوری (69%) وجود دارد و بیشترین فراوانی (89%) از استان شمال غربی ایران، اردبیل گزارش شده است، جائیکه بیش از 90% از افراد بالای 40 سال التهاب مزمن وابسته به عفونت هلیکوباکترپیلوری رادارند و سرطان معده، 31% از بدخیمی ها را تشکیل می دهد. گزار ش ها نشان داده که ژنوتیپ های مشخصی از هلیکوباکترپیلوری ممکن است با ایجاد پی آمد های بالینی شدید ناشی از بیمار ی های معده ای-روده ای در ارتباط باشند، ژ ن های vaca وcaga که از ژ ن های بیماری زای هلیکوباکترپیلوری هستند، از عوامل مهم در ایجاد بیماری محسوب می شوند. ناهمگونی در میان الل های vaca ممکن است فاکتور مهمی در ایجاد پی آمد بالینی متفاوت در افراد آلوده به هلیکوباکترپیلوری باشد و ارتباط بین ژنوتیپ های مشخص از vaca و خطر بالای زخم معده، آتروفی و سرطان معده نشان داده شده است. سویه های با الگوی اللی i1 قویا با آدنوکارسینومای معده مرتبط می باشند (p<10-3)،. اخیراً، یک حذف 81bp بین ناحیه ی m و i شناسایی شد که ناحیه (d) نامیده شد. ارتباط بین ژنوتیپ های vaca هلیکو باکتر پیلوری، بخصوص الل های s1/i1/m1 و بروز سرطان معده در ایران در مطالعات متعدد نشان داده شده است. مطالعه ی اخیر در ایران پیشنهاد می کند که الل های vaca d1/-i1 می تواند بعنوان بیو مارکر های خطر در مناطق با شیوع بالای سرطان معده در ایران در نظر گرفته شود. در این مطالعه الل های جدید در لوکوس بیماری زای vaca هلیکوباکترپیلوری مورد جستجو قرار گرفته و ارتباط آن با بیماری های گوارشی بررسی می گردد که می تواند زمینه را برای طراحی راهکار های جدید برای کاهش وقوع سرطان معده و ضایعات پیش سرطانی بویژه در نواحی پر خطر فراهم کند. برای این مطالعه . باکتری ها در محیط های انتخابی کشت و در ادامه dna آن ها استخراج شده و توسط pcr تکثیر می شود. تعیین توالی برخی قطعه های مربوط به الل های ژن vaca توسط هر دو توالی پرایمری برگشتی با استفاده از تکنولوژی bigdye انجام می شود. در ادامه آنالیزهای بیوانفورماتیکی پیشرفته، آنالیزهای آماری و تفسیر داده ها انجام می شود