نام پژوهشگر: معصومه رجبی‌بذل

تهیه نانوبادی نوترکیب مشتق شده از آنتی بادی های زنجیره سنگین شتری بر علیه آنتی ژن agsk1 سرطان روده بزرگ
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شاهد - دانشکده علوم پایه 1392
  میرخلیل رشیدی   معصومه رجبی بذل

سرطان روده بزرگ یکی از علل اصلی مرگ و میر ناشی از سرطان در جهان است .درمان اصلی رایج در حال حاضر شیمی سرطان روده بزرگ یکی از علل اصلی مرگ و میر ناشی از سرطان در جهان است .درمان اصلی رایج در حال حاضر شیمی درمانی و جراحی است. با توجه به عوارض جانبی و کم اثر بودن روشهای درمانی موجود، شانس زنده ماندن بیماران کمتر از 5 سال می باشد. درمان موثر به تشخیص زود هنگام و ارسال مناسب داروها به سلول های سرطانی بستگی دارد. agsk1 یکی از مارکرهای اختصاصی سرطان کولورکتال است. در این مطالعه هدف ما تهیه نانوبادی بر علیه آنتی ژن agsk1 با روش نمایش فاژی است که می تواند در تشخیص زود هنگام سرطان روده بزرگ موثر باشد. در این مطالعه کتابخانه فاژ نانوبادی تهیه شده طی پروسه panning بر علیه ht29 وls174t مورد استفاده قرار گرفت. رده سلولی hela (agsk1-) به عنوان کنترل منفی برای حذف نانوبادیهای غیر اختصاصی استفاده شد. فاژهای به دست آمده برای جدا سازی نانوبادیهای اختصاصی علیه agsk1 با استفاده از سلولهای ht29 و ls174t مورد استفاده قرار گرفت. سلول ht29 و ls174t با بیان بالای agsk1 برای جدا سازی نانوبادیهای اختصاصی بر علیه آنتی ژن agsk1 استفاده شدند. نانوبادیهای جدا شده با تمایل بیشتری برای سلول های سرطان روده بزرگ توسط elisa مورد آزمایش قرار گرفتند. چهار دور از پروسه panning بر علیه سلولهای سرطانی ht29 و ls174t انجام شد که نانو بادی جدا شده در panning سوم بالاترین تمایل را برای آنتی ژن agsk1 طی واکنش الایزای پلی کلونال را نشان دادند. بیست کلونی برای جدا سازی نانو بادی با بالاترین تمایل اتصال بر علیه آنتی ژن ,agsk1 توسط ls174t که دارای سطح بیان بالاتری بودند، استفاده شدند. نانوبادی جدا شده دارای تمایل اتصال بیشتر بر علیه سلولهایls174t(agsk1 +) و ht29 درمقایسه با رده سلولی hela (agsk1-)دارد. نانوبادی جدا شده قادر به تشخیص آنتی ژن سرطان کولورکتال (agsk1) در سطح سلول های سرطانی است. این نانوبادی می تواند برای انتقال دارو به سلول های سرطانی و یا تشخیص زود هنگام سرطان روده بزرگ مورد استفاده قرار گیرد. و جراحی است. با توجه به عوارض جانبی و کم اثر بودن روشهای درمانی موجود، شانس زنده ماندن بیماران کمتر از 5 سال می باشد. درمان موثر به تشخیص زود هنگام و ارسال مناسب داروها به سلول های سرطانی بستگی دارد. agsk1 یکی از مارکرهای اختصاصی سرطان کولورکتال است. در این مطالعه هدف ما تهیه نانوبادی بر علیه آنتی ژن agsk1 با روش نمایش فاژی است که می تواند در تشخیص زود هنگام سرطان روده بزرگ موثر باشد. در این مطالعه کتابخانه فاژ نانوبادی تهیه شده طی پروسه panning بر علیه ht29 وls174t مورد استفاده قرار گرفت. رده سلولی hela (agsk1-) به عنوان کنترل منفی برای حذف نانوبادیهای غیر اختصاصی استفاده شد. فاژهای به دست آمده برای جدا سازی نانوبادیهای اختصاصی علیه agsk1 با استفاده از سلولهای ht29 و ls174t مورد استفاده قرار گرفت. سلول ht29 و ls174t با بیان بالای agsk1 برای جدا سازی نانوبادیهای اختصاصی بر علیه آنتی ژن agsk1 استفاده شدند. نانوبادیهای جدا شده با تمایل بیشتری برای سلول های سرطان روده بزرگ توسط elisa مورد آزمایش قرار گرفتند. چهار دور از پروسه panning بر علیه سلولهای سرطانی ht29 و ls174t انجام شد که نانو بادی جدا شده در panning سوم بالاترین تمایل را برای آنتی ژن agsk1 طی واکنش الایزای پلی کلونال را نشان دادند. بیست کلونی برای جدا سازی نانو بادی با بالاترین تمایل اتصال بر علیه آنتی ژن ,agsk1 توسط ls174t که دارای سطح بیان بالاتری بودند، استفاده شدند. نانوبادی جدا شده دارای تمایل اتصال بیشتر بر علیه سلولهایls174t(agsk1 +) و ht29 درمقایسه با رده سلولی hela (agsk1-)دارد. نانوبادی جدا شده قادر به تشخیص آنتی ژن سرطان کولورکتال (agsk1) در سطح سلول های سرطانی است. این نانوبادی می تواند برای انتقال دارو به سلول های سرطانی و یا تشخیص زود هنگام سرطان روده بزرگ مورد استفاده قرار گیرد.

بررسی تاثیر دوگیاه خوشاریزه و مرزه بختیاری بر کاهش بیان ژن های مقاومت دارویی mdr1 و erg11 در کاندیدا آلبیکنس مقاوم به فلوکونازول به روش real time pcr
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پزشکی 1392
  پیمان اصلانی   محمدحسین یادگاری

کاندیدا آلبیکنس مخمر فرصت طلبی می باشد که در افرادی با نقص سیستم ایمنی ودرصورت وجود شرایط مستعد کننده به قارچ بیماری زا تبدیل میشود و عفونت های کشنده و جدی ایجاد می کند. گیاهان مرزه بختیاری و خوشاریزه دارای اثرات ضد قارچی میباشند. در این تحقیق اثرات این گیاهان بر میزان بیان ژن های mdr1 و erg11 بررسی گردید که این دو ژن در مقاومت به فلوکونازول نقش دارند. مواد و روش ها: عصاره های الکلی مرزه و خوشاریزه بعد از خشک کردن گیاهان با روش پرکولاسیون آماده سازی شدسپس رقت های 500، 256، 125، 64، 32، 16، 8، 4، 2، 1 میلیگرم بر میلی لیتر از آنها تهیه شده و با 1×106 عدد از ایزوله های بالینی کاندیدا آلبیکنس وگونه استاندارد مجاور و حداقل غلظت مهارکنندگی وحداقل غلظت کشندگی در محیط سابورو ارزیابی شد. سپس نمونه های بالینی کاندیدا آلبیکنس با mic دوگیاه تیمار شد.از نمونه های بالینی قبل و بعد از تیمار با خوشاریزه و مرزه بختیاری rna استخراج و سپس cdna سنتز گردید و واکنش real time pcr انجام گردید. نتایج نشان داد که حداقل غلظت مهارکنندگی برای عصاره الکلی مرزه در ایزوله های بالینی کاندیدا آلبیکنس 256 میلی گرم بر میلیتر و برای عصاره خوشاریزه 64 میلی گرم بر میلیتر بوده است. حداقل غلظت کشندگی برای عصاره الکلی مرزه در ایزوله های بالینی کاندیدا آلبیکنس 512 میلی گرم بر میلیتر و برای عصاره خوشاریزه 128 میلی گرم بر میلیتر بوده است. همچنین گیاه خوشاریزه قادر بود که ژن erg11 را مهار کند. اما عصاره مرزه بر روی هر دو ژن بی تاثیر بود. امروزه به دلیل ایجاد مقاومتهای دارویی استفاده از گیاهانی که دارای خاصیت ضد میکروبی مناسب و اثرات جانبی کمتری میباشند، رو به افزایش است. با توجه به نتایج تحقیق حاضر بر قدرت خوشاریزه بر کاهش بیان ژن erg11 که در مقاومت به فلوکونازول نقش دارد، میتوان این گیاه را بعنوان جایگزین مناسب داروها و یک ترکیب ضد قارچی موثر معرفی کرد.

بررسی توزیع ژنوتایپ های کاندیدا آلبیکنس در بیماران مبتلا به ولوواژینیت با علائم بالینی متفاوت با استفاده از روش های مولکولی تعیین توالی و pcr-sscp و تفاوت بیان ژن efg1p دراسترین های مختلف در شهر زاهدان
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پزشکی 1394
  بهمن فولادی   محمدحسین یادگاری

کاندیدا آلبیکنس به عنوان شایع ترین و مهمترین پاتوژن در بیماران مبتلا به ولوواژینیت محسوب می شود. به لحاظ اپیدمیولوژیک تعیین استرین های کاندیدا آلبیکنس و طبقه بندی آنها در بیماران مبتلابه ولوواژینیت جهت جلوگیری از گسترش عفونت مهم است.در ژنوم کاندیدا آلبیکنس تعدادی لوکوس cai است که در ناحیه غیر کد شده ظاهر شده و بطور معنی دار پلی مورفیک استرین ها را مشخص می کند،بنابراین استفاده از توالی های تکراری کوتاه یامیکروساتلیت ها جهت تایپینگ جمعیت های ژنتیکی وژنوتایپی میکروارگانیزم ها کاربرد وسیعی دارد. پروتئینefg1p ازفاکتورهای ویرولانس مهم میباشد که در چسبندگی به سلول میزبان و دی مورفیسم، تولید آنزیم های دژنره کننده و ترشحی ومورفولوژی سوئیچینگ نقش مهمی دارد وبررسی بیان آن در ژنوتیپ های بدست آمده ضروری است. هدف از این مطالعه بررسی توزیع ژنوتایپ های کاندیدا آلبیکنس در بیماران مبتلا به ولوواژینیت با علائم بالینی متفاوت، با استفاده از روش های مولکولی تعیین توالی pcr-sscp و تفاوت بیان ژن efg1pدر استرین های مختلف در شهر زاهدان می باشد. از بیماران مشکوک به بیماری ولوواژینیت نمونه های واژینال تهیه و در محیط های sda، کروم آگار و کورن میل آگار کشت داده شد. واکنش pcr-rflpبر روی قطعه its1- 5.8s – its2با آنزیم mspi برای شناسایی گونه های کاندیدا و از آنزیمmboiبرای تائید گونه های آلبیکنس، دابلینینسیس انجام شد. جهت انجام واکنش pcr-sscp، dna تهیه و تکثیر میکروساتلیت لوکوس cai انجام شد. تعدادی ازمحصولات pcrنمونه ها با پرایمر اختصاصی با استفاده از پروتوکل کیت تخلیص و تعیین توالی گردید. جهت بررسی بیان ژن efg1p ازتعدادی ژنوتیپ های بدست آمده، استخراج rna و تبدیل آن به cdna با پرایمرهای اختصاصی ژن صورت گرفت وپس ازانجام واکنش real time pcr، بیان ژن نسبت به ژن رفرانس توسط نرم افزار دستگاه abi محاسبه شد.از 350 نمونه مورد مطالعه، 165 مورد از نظر کاندیدا (47/14%) مثبت بود. گونه های شناسایی شده با روشpcr-rflpشامل: کاندیدا آلبیکنس 100 ایزوله (60/6%)، کاندیدا دابلینینسیس 6 ایزوله (6/3%) و کاندیدا گلابراتا 38 ایزوله (23%) ، کاندیدا کروزی 19 ایزوله (11/5%) و کاندیدا تروپیکالیس 2 ایزوله (1/2%)،و از کل 165 نفر ، 118 مورد (71/5%) فرم کاندیدیازیس عود کننده و 47 نفر (28/5%) مبتلا به فرم حاد بودند. شیوع عفونت در مرحله حاد و عود بیماری با گونه کاندیدا آلبیکنس و گونه های غیر کاندیدا آلبیکنس تفاوت معنی داری را نشان نداد((p=0.6. براساس الگوهای متفاوتی قطعات cai تکثیر شده و مقایسه باندها با استرین استاندارد ، 26 ژنوتیپ متفاوت با توجه با کانفورماسیون و شکل فضایی شناسایی شدند .ژنوتیپ a, k, q, iبیشترین فراوانی و به عنوان ژنوتیپ های غالب در نظر گرفته شدند .ژنوتیپ i در شکل حاد وژنوتیپ a در فرم مزمن بیماری مشاهده شد.نتایج درختچه فیلوژنتیک با استفاده ازتوالی 5.8s نشان داد که فاصله ژنتیکی حاصل از روش pcr-sscpبا نتایج حاصل از توالی سکانس در محدوده جنس و گونه مطابقت دارد.نتایج بیان ژن efg1p نشان دادکه ارتباط بین میزان بیان ژن efg1p، عود مجدد وشکل شدید بیماری معنی دار می باشد(p<0.05). آنالیز آزمایشات مولکولی شامل تعیین توالی قطعه 5.8 s،pcr-sscp مارکر caiو بیان ژن efg1p نشان داد که در هر سه مارکر تنوع وجود دارد و مطالعه توانست پانل جامعی را از مارکرهای فنوتیپی و ژنوتیپی در سویه های منحصر به فرد جمع آوری نماید و این روش می تواند برای تعیین استرین های کاندیدا آلبیکنس وتعیین تغییرات کوچک تکاملی در میکروساتلیت ها و بررسی large scale اپیدمیولوژیکی مورد استفاده قرار گیرد.