نام پژوهشگر: علی نخعی‌پور

مطالعه نظری جذب سطحی هیدروژن بر روی نانوساختارهای کبالت
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه فردوسی مشهد - دانشکده علوم پایه 1393
  زهرا کیوانلو   علی نخعی پور

در این مطالعه، بررسی نظری جذب هیدروژن بر روی صفحات مختلف از ساختار شبکه مکعبی مرکز وجوه پر و همچنین خوشه‏های نانوساختاری فلز کبالت با استفاده از روش نظریه تابعی چگالی (dft) انجام شده است. همه محاسبات با استفاده از نرم‏افزار adf و با تابع revpbe-d3(bj) زیرشاخه‏ای از gga-d و مجموعه پایه dz انجام گرفته است. برای دست‏یابی به این منظور، ابتدا ساختار شبکه مکعبی مرکز وجوه پر (fcc) فلز کبالت از لحاظ انرژی بهینه گردید و سپس صفحات (100)، (110) و (111) از این شبکه جهت انجام بررسی‏های جذب هیدروژن، انتخاب گردید. در ادامه، انرژی جذب هیدروژن (به‏صورت اتمی و مولکولی) و فرکانس‏های ارتعاشی آن‏ها در موقعیت جذبی سر به سر و سه پوشش متفاوت 25 درصد، 50 درصد و کامل (100درصد) برای هر صفحه، محاسبه گردید. نتایج حاصل از محاسبات نشان می‏دهد انرژی‏های جذب هیدروژن، هم به‏صورت مولکولی و هم به‏صورت اتمی، با افزایش میزان پوشش سطح، کاهش می‏یابد. همچنین با مقایسه انرژی جذب سطحی اتم و مولکول هیدروژن بر روی صفحات مختلف، مشخص گردید که انرژی‏ جذب سطحی متناسب با انرژی کشش سطحی (y) بوده و با افزایش انرژی کشش سطحی برای سطوح مورد مطالعه، افزایش می‏یابد. نتایج نشان می‏دهد که برای بلور fcc، روند افزایش انرژی کشش سطحی (y) صفحات (100)، (110) و (111)، به‏صورت 111< y100> y110yمی‏باشد. بر اساس نتایج به‏دست آمده با افزایش انرژی کشش سطحی، فاصله‏ اتم و مولکول هیدروژن نسبت به سطح کاهش و طول پیوند h-h در جذب مولکولی (فیزیکی) افزایش می‏یابد. همچنین فرکانس‏های ارتعاشی مولکول‏ها و اتم‏های هیدروژن متصل شده به سطح و فرکانس ارتعاشی کششی h-h بر روی سطوح مختلف ساختار مکعب مرکز وجوه پر کبالت با افزایش انرژی کشش سطحی، به‏ترتیب افزایش و کاهش می‏یابد. نتایج بررسی‏های انجام شده بر روی خوشه‏های کبالت نشان می‏دهد با کاهش ابعاد خوشه، انرژی جذب سطحی اتم‏های هیدروژن افزایش می‏یابد.

مطالعه سینتیکی هیدرولیز و پرهیدرولیز استیل کولین توسط آنزیم لیپاز b در حضور دی-ام-ام-پی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه فردوسی مشهد - دانشکده علوم 1394
  محمد صادق صادقی گوغری   محمد رضا حسین دخت

در این طرح با استفاده از روش های نظری مکانیسم واکنش های آنزیمی آنزیم کاندیدا آنارتیکا لیپاز بی (calb) با دو سوبسترای استیل کولین (ach) و متیل کاپریلیت (mec) و همچنین بازدارنده دی متیل متیل فوسفونات (dmmp) بررسی شدند. در ابتدا با به کارگیری روش های داکینگ، مکانیک مولکولی- مکانیک کوانتومی (qm/mm) و شبیه سازی دینامیک مولکولی فرایند تشکیل کمپلکس آنزیم...لیگاند که به عنوان مرحله شروع کننده واکنش نقش بسیار مهمی در این نوع از واکنش ها دارد بررسی شده و مشخص شد که هر سه لیگاند فوق توانایی تشکیل این کمپلکس را دارا می باشند.پس از تائید نظری مرحله شروع کننده ، مکانیسم واکنش های هیدرولیز و پرهیدرولیز هر دو سوبسترا با استفاده از روش های تابعی چگالی (dft) بر اساس مکانیسم تجربی این نوع واکنش ها مورد بررسی قرار گرفت. بدین منظور مدل هایی ساختاری از گونه های شیمیایی درگیر در واکنش ها طراحی شده و نمودارهای انرژی و انرژی آزاد مربوط به مسیر هر واکنش تعیین شدند.