در این پژوهش تنوع ژنتیکی مرغان بومی گردن لخت با استفاده از تجزیه و تحلیل ژنوم میتوکندری مورد بررسی قرار گرفت. یک قطعه 455 جفت بازی از ناحیه d-loop ژنوم میتوکندری 10 مرغ گردن لخت توالی‏یابی شد. در کل دو هاپلوتیپ شناسایی شد. تنوع هاپلوتیپی و تنوع نوکلئوتیدی در مرغان بومی گردن لخت به ترتیب 01591/0 ± 3556/0 و 002356/0 ± 003133/0 بود. پس از اخذ توالی‏های مشابه ژنوم میتوکندری دیگر نژادهای موجود در بانک جهانی ژن درخت فیلوژنی با استفاده از آن‏ها ترسیم شد. نتایج فیلوژنی مشخص کرد که مرغ بومی گردن لخت با مرغ بومی مرندی، لاری، فارس، مازندرانی، پیلموت‏راک و مرغ جنگلی خاکستری در یک دسته قرار دارند. بنابراین می‎توان نتیجهگیری کرد که مرغ گردن لخت احتمالاً واجد برخی شباهت‎های ژنتیکی با این نژادها می‎باشد.