سازمان پروژه محور، سازمانی است که پروژه رکن اصلی آن می باشد و یک مجموعه از انواع پروژه ها را مدیریت می کند. امروزه در سازمان های پروژه محور، اولویت بندی پروژه ها نه تنها مهم است، بلکه در بسیاری موارد امری حیاتی برای سازمان محسوب می شود. اما اینکه کدام پروژه ها و با کدام شاخص ها و اهداف انتخاب شوند، پرسشی است که با حل مسأله ی رتبه بندی و انتخاب بهینه ی پروژه بدان پاسخ داده می شود. موضوع مهم دیگر، پیاده سازی یک سیستم کارای مدیریت پروژه در پروژه های انتخابی است. در مدیریت پروژه یکی از معیارهای موفقیت پروژه، ایجاد موازنه ی بهینه بین زمان و هزینه ی اجرا است. این مسأله در سازمان های پروژه محور نقش ویژه ای دارد و انتخاب سیاست های تخصیص منابع به پروژه های مختلف، این دو عامل را به صورت قابل ملاحظه ای تحت تأثیر قرار می دهد. در این پژوهش، دانشگاه یزد به عنوان سازمانی که پروژه های متعددی را در سال به اجرادر می آورد، انتخاب شده است. هدف بخش اول، رتبه بندی کامل پروژه های عمرانی سال 93 دانشگاه یزد با استفاده از رهیافت ترکیبی تحلیل پوششی داده ها و فرآیند تحلیل سلسله مراتبی است. داده های ورودی عبارت از: هزینه و زمان انجام پروژه و خروجی ها نیز کیفیت و تطابق استراتژیک. در بخش دوم: مسأله ی تصمیم گیری مدیریت پروژه، با اهداف چندگانه در یک محیط فازی مطرح می گردد. مدل ارائه شده، برنامه ریزی خطی چندهدفه ی فازی، با هدف به حداقل رساندن هزینه ی کل پروژه انتخابی تعیین مقدار بهینه افزایش هزینه های مستقیم به ازای کاهش مدت زمان پروژه و کاهش بهینه زمان تکمیل پروژه می باشد. برای حل مس?له از روش دو مرحله ای و برای معرفی داده های فازی از تابع تعلق مثلثی استفاده شده است. در نهایت برای اعتبارسنجی روش پیشنهادی یک مثال عددی که مربوط به یک پروژه ی عمرانی است در نظر گرفته شده است. برای پیاده سازی مسال از نرم افزار گمز استفاده شده است. نتایج بدست آمده ما را به این مهم رهنمون می سازد که مدل پیشنهادی می تواند به عنوان یک ابزار موثر در موارد مشابه و برای دیگر تصمیم گیری های چندهدفه مورد استفاده قرار بگیرد.