یکی از مهم ترین پیشرفت های علمی در سه دهه اخیر، pcr یا واکنش زنجیره‏ای پلیمراز است. این "انقلاب علمی" روشی برای کپی کردن قطعه مشخصی از دی.ان.ای است. تکثیر بخش خاصی از دی.ان.ای، کاربردهای بسیار زیادی دارد، ازجمله در تشخیص بیماری هایی از قبیل سرطان، تعیین قدمت در علوم باستان شناسی، اثرانگشت ژنتیکی در پزشکی قانونی و بسیاری دیگر از کاربردها. به منظور انجام واکنش‏های زنجیره‏ای پلیمراز، افزایش و کاهش از پیش تعیین شده ای برای دمای نمونه لازم است. ترموسایکلرpcr دستگاهی است که بر پایه روش واکنش زنجیره ای پلیمراز استوار است و اغلب برای تکثیر بخش‏هایی از دی.ان.ای استفاده می‏شود. این دستگاه دارای یک بلوک حرارتی است که در آن تیوب های حاوی مخلوط واکنش قرار داده می‏شوند. سپس بخش کنترل کننده، دمای بلوک را در مراحل گسسته و از پیش برنامه ریزی شده ای افزایش و کاهش می‏دهد. فاکتور دما در طی انجام فرآیند، باید با دقت بالا کنترل گردد تا عمل تکثیر نمونه دچار اختلال نشود. در این پایان نامه سعی شده است کنترلر ترموسایکلر pcr، طراحی و ساخته شود چراکه ساخت این دستگاه و بهره‏وری از آن در مراکز آزمایشگاهی و تحقیقاتی، منجر به حصول نتایج چشمگیر و سودمند درزمینه تشخیص آزمایشگاهی و همچنین مطالعات ژنتیکی خواهد شد.