گیاه خلر متعلق به تیره لگومینوز می باشد و جزء گیاهان علوفه ای به شمار می آید. دوره رشد آن کوتاه بوده و بسیار متحمل به خشکی است؛ به علاوه خلر سازگار به فصول سرد و یخبندان می باشد. جوانه زنی یکی از مهمترین مراحل بحرانی در نمو گیاهان می باشد. جوانه زنی بذر جز صفت پیچیده ای است که توسط تعداد زیادی از ژن ها و عوامل محیطی کنترل می شود. lhcb نوسانات دوره ای منظم را نشان می دهد و به عنوان ساعات مولکولی در گیاهان شناخته شده است. ژن cts، abc ترانسپورتری ست که حمل و نقل مواد به پراکسی زوم در گیاهان را انجام می دهد. امروزه برای شناسایی عملکرد و نقش ژن ها در فرآیندهای زیستی، میزان بیان آنها در شرایط مختلف بررسی می گردد. بررسی بانک ژن نیز نشان می دهد که ژن های اندکی از گیاه خلر تعیین توالی گردیده اند. در این تحقیق نقش دو ژن lhcb و cts در جوانه زنی خلر مورد مطالعه قرار گرفت. بنابراین توالی ژن lhcb و cts شناسایی شده و پس از آن بیان رونوشت آنها در جوانه زنی بذور خلر مورد بررسی قرار گرفت. برای جداسازی این ژن ها آغازگرهای اختصاصی از گیاه نخودفرنگی و سویا براساس توالی ژن lhcb و cts در این دو گیاه طراحی شد. توالی جداشده ژن lhcb bp 601 طول دارد که 480 نوکلئوتید آن مربوط به نواحی اگزونی و بقیه مربوط به اینترون می باشد. منطقه شناسایی شده واجد دمین متصل شونده به کلرفیلa/b نیز هست. 3 توالی برای ژن cts جدا شده اما هیچ کدام abc ترانسپورتر نبوده اند. بذور خلر از توده ی بومی حسن آباد بیرجند تهیه شد. جوانه زنی 8 ساعت پس از آبنوشی شروع شد و در 24 ساعت به پایان رسید. در زمان های ??، ?? و ?? ساعت پس از آب نوشی نمونه برداشت شده و cdna ساخته شد. سپس با کمک آغازگرهای اختصاصی برای ژن های cts و lhcb، rt-pcr گذاشته شد. بیان ژن در همه مراحل انجام گردید اما بیان ژن در هیچ کدام از مراحل صورت نگرفت که نشان دهنده انتخاب زمان های نامناسب در این تحقیق بوده است.