رابطه فیلوژنی بین 12 گونه وحشی prunus ، یک رقم زراعی بادام و یک رقم هلو، با استفاده از توالی های ناحیه its1-5.8s rdna-its2 ژن ریبوزومی و ناحیه trnl dna کلروپلاستی مورد ارزیابی قرار گرفت. توالی های نوکلئوتیدی حاصل از این بررسی در بانک ژن ncbi به کمک nucleotide blast مورد شناسایی قرار گرفتند. داده ها توسط برنامه clustal x هم ردیف شدند. میزان تناسب هم ردیفی ها با آنالیز فیلوژنیک به کمک روش آنالیز نقشه یابی حداکثر درست نمایی (lma) و با به کارگیری نرم افزار tree-puzzle-5.2براساس آنالیز چهار بخشی انجام گرفت. روش های حداکثر شباهت و نزدیکترین همسایگی به منظور آنالیز ماتریس داده های حاصل، توسط نرم افزار paup*4.0 beta استفاده گردیدند. علاوه بر این، برای بالا بردن دقت یکبار دیگر نیز داده ها با استفاده از نرم افزار mega مورد بررسی قرار گرفتند. فواصل ژنتیکی برای هرجفت از گونه ها مشخص شد و میانگین فاصله ژنتیکی در بین گونه ها تنها کمترین فاصله ژنتیکی را در داخل جنس نشان می دهد.