استرپتوکوک پنومونیهدر دستگاه تنفسی فوقانی افراد یافت می شود و بخشی از فلور طبیعی آن است. استرپتوکوک پنومونیه می تواند به آسانی از فرد حامل به فرد دیگری به طور مسستقیم ونا محسوس منتقل شود. مطالعات زیادی شیوع کلونیزه شدن استرپتوکوک پنومونیه رادر نازوفارنکس اکثر کودکان ،بخصوص در کشورهای در حال توسعه نشان می دهد. تعداد 260 سواپ از ناحیه نازوفارنکس کودکان 1ماهه تا6 ساله د ر4 گروه سنی در شهرستان مشهد جمع آوری گردیدند. د راین نمونه ها، جدایه های استرپتوکوک پنومونیه با آزمایش های بیوشیمیایی و مولکولی مورد شناسایی قرار گرفتند. از روشpcr جهت حضور ژن های lyta,rrga وpspc در جدایه ها استفاده شد. سروتایپینگ جدایه ها با استفاده از روش multiplex pcr انجام گردید. نتایج نشان داد که 59 جدایه به عنوان استرپتوکوک پنومونه تایید شد. در میان این جدایه ها استرپتوکوک پنومونیه 50جدایه(74/84%)، 19جدایه (20/32%) و2جدایه(38/3%) به ترتیب دارای ژنهای rrga ,lyta و pspcبودند. 4 الگوی فاکتورهای حدت در میان جدایه های استرپتوکوک پنومونیه عبارت بودند از: 1)lyta,rrga,pspc 1جدایه 2) lyta,rrga17جدایه 3) pspc2جدایه 4 )lyta50 جدایه. تفاوت آشکاری دربین 4 گروه سنی کودکان بر اساس جنس در کلونیزه شدن استرپتوکوک پنومونیه وجود نداشت. سروتیپ6a/b دارای بیشترین فراوانی در بین گروه های سنی بود. سروتیپ های 6a/b,3,19a,18و14، در5/52% از جدایه هاگزارش شدند. بیشترین جدایه ها در گروه سنی72-54 ماهه وجود داشتند. این مطالعه نشان دهنده میزان بالای ناقلین پنوموکوک در ناحیه نازوفارنکس کودکان با سن 72-54 ماهه در مشهد می باشد. بنابر این مطالعات اپیدمیولوژیکی می تواند، سروتیپ های شایع در ناقلین را مشخص نماید که این مسئله در تولید واکسن موثر بر علیه پنوموکوک مفید می باشد.