در این مطالعه شبیه سازی دینامیکی پیل سوختی غشاء پلیمری انتها بسته، در حوزه های الکتریکی، سیالاتی و حرارتی با جریان های الکتریکی مختلف مورد بررسی قرار گرفته است. نتایج بر اساس منحنی های جریان الکتریکی، دما و ولتاژ در لایه های مختلف استک پیل سوختی ارائه شده اند. همچنین برای کاهش وابستگی معادلات حاکم به اطلاعات تجربی از روش شناسایی پارامتری استفاده شده است. روش شناسایی پارامتری روشی است که با معرفی تعدادی ضرایب ثابت به معادله اصلی به جای ضرایب تجربی، معادله جدیدی را بدست می آورد که برای شرایط مختلف غیر از شرایط موجود هم قابل استفاده می باشد. در این راستا از یکی از مدل های روش شناسایی پارامتری به نام مدل جعبه خاکستری استفاده شده است که علاوه بر روابط تئوری از اطلاعات تجربی هم بهره می گیرد. در شبیه سازی اثر پارامترهای مختلف از قبیل جریان های الکتریکی ثابت، پله ای و نویزی در پیل سوختی مورد بررسی قرار گرفته است. مقایسه بین نتایج بدست آمده از روش شناسایی پارامتری با نتایج کارهای موجود دقت مناسب این روش را نشان می دهد.