بیماری لکه قهوه ای قارچ خوراکی ناشی از pseudomonas tolaasii یکی از بیماری های مهم و اقتصادی است. این بیماری یکی از عوامل محدود کننده تولید و کاهش بازار پسندی قارچ خوراکی است. طی سال های 1393-1391 جدایه های مربوط به این بیمارگر از استان فارس از لحاظ خصوصیات ژنوتیپی و ردیابی و تعیین ترادف نوکلئوتیدی ژن های موثر در بیماری زایی مورد بررسی قرار گرفتند. کلیه جدایه های بیماری زا قطعه 449 جفت بازی که بر اساس ژن تولاسین طراحی شده بود را در واکنش pcr بوسیله جفت آغازگر های pt1a/pt1d1 تکثیر نمودند، ولی جدایه های غیر بیماری زا قادر به تکثیر این قطعه نبودند. ترادف نوکلئوتیدی این ژن در سطح 100-72% با جدایه های غیر ایرانی شباهت داشت. کلیه جدایه های بیماری زا قطعه 1200 جفت بازی را در واکنش pcr بوسیله جفت آغازگر phen1/phen2 تکثیر کردند اما جدایه های غیر بیماری زا قادر به تکثیر قطعه 1800 جفت بازی نبودند. این موضوع نشان داد که در جدایه های p. tolaasii مربوط به استان فارس تبدیل جدایه بیماری زا به غیر بیماری زا انجام نمی گیرد. تعیین ترادف نوکلئوتیدی ژن phen و مقایسه آن با جدایه های غیر ایرانی شباهت در سطح 89-76% را به نواحی حسگر و تنظیم کننده ژن های تنظیم کننده دو قسمتی ((two-component regulatory genes در سودوموناس های فلورسنت نشان داد. برای تعیین خصوصیات ژنوتیپی آزمون rep-pcr با آغازگر های rep1r/rep2i، eric1r/eric2 و boxa1r انجام گرفت. بر اساس آنالیز خصوصیات ژنوتیپی تمامی جدایه ها در دو گروه اصلی قرار گرفتند. جدایه های بیماری زا دارای شباهت در سطح 82-79% به سودوموناس های فلورسنت بودند.گروه بندی جدایه های استان فارس بر اساس خصوصیات ژنوتیپی با گروه بندی بر اساس خصوصیات فنوتیپی مطابقت داشت.