هدف این پژوهش بررسی تأثیراستفاده ازنرم افزارکیف الکترونیکی برانگیزش تحصیلی، مهارتهای پژوهشی و پیشرفت تحصیلی دانش آموزان دختردوره دوم متوسطه در درس زیست شناسی شهرستان پاکدشت سال تحصیلی 93-92 می باشد. این تحقیق از نوع بنیادی ودرعین حال نیمه تجربی می باشد.طرح تحقیق به شکل پیش آزمون-پس آزمون باگروه گواه وآزمایش می باشد. جامعه آماری تحقیق شامل کلیه دانش آموزان دختر پایه دوم رشته علوم تجربی شهرستان پاکدشت درسال تحصیلی 93-1392 می باشد.نمونه آماری شامل چهار کلاس از مدارس دخترانه دوره دوم متوسطه می باشد. حجم نمونه برای گروه آزمایش برابر با 60دانش آموز از مدارس هوشمند وبرای گروه گواه نیز برابر با 60 دانش آموز از مدارس عادی به روش تصادفی خوشه ای انتخاب شدند. در گروه آزمایش از نرم افزار کیف الکترونیکی استفاده شد ودر گروه گواه از آموزش معمول کلاسی استفاده شده است.از پیش آزمون وپس آزمون برای سنجش انگیزش تحصیلی(پرسشنامهism)،مهارتهای پژوهشی(پرسشنامه محقق ساخته) وپیشرفت تحصیلی(آزمون معلم ساخته) استفاده گردیده است. یافته های بخش نظری تحقیق نشان می دهد که کاربرد آموزش مبتنی بر رایانه در دانش‎آموزان احساس بهتری نسبت به موفقیت در مدرسه ایجاد می‎کند و دانش‎آموزانی که در مدارس فن آوری‎محور آموزش می‎بینند، نسبت به دانش‎آموزان مدارس عادی از عزت نفس و اعتماد به نفس بیشتری برخوردارند و از نظر دبیران و مدیران، این نوع مدارس از پرستیژ و جایگاه اجتماعی بالاتری در جامعه و نزد والدین برخوردارند. نتایج تحلیل واریانس نشان می دهد که استفاده از نرم افزارکیف الکترونیکی برانگیزش تحصیلی،مهارتهای پژوهشی وپیشرفت تحصیلی دانش آموزان{متغیر انگیزش تحصیلی (775/0=f ؛ 381/0=sig)؛ مهارتهای پژوهشی (12/13=f ؛ 000/0=sig)؛ پیشرفت تحصیلی (01/38=f ؛ 000/0=sig)}تأثیر دارد وتفاوت معنی داردر گروه آزمایش نسبت به گروه گواه وجود دارد.استفاده از نرم افزارکیف الکترونیکی بیشترین تأثیر را از بین مولفه های انگیزش تحصیلی، بر مولفه گرایش به پیشرفت(f=60/41) وازبین مولفه های مهارتهای پژوهشی، بیشترین تأثیر را بر مولفه انتخاب موضوع(f=117/36)داشته است.