در این پژوهش،مقایسه بهره وری بین محصول ارگانیک و غیر ارگانیک گوجه فرنگی درسال زراعی92-1391 در شهرستان ابهر، قطب تولید گوجه فرنگی استان زنجان مقایسه شده است. داده های لازم از طریق تکمیل پرسشنامه به تفکیک ازتولید کنندگان ارگانیک و غیرارگانیک گوجه فرنگی که به روش نمونه گیری دو مرحله ای خوشه ای تصادفی انتخاب گردیده، جمع آوری شده است. جهت مقایسه بهره وری بین محصول ارگانیک و غیرارگانیک گوجه فرنگی از تابع تولید کاب-داگلاس که از بین توابع مختلف بهترین تابع شناخته شد،استفاده شده است. جهت محاسبه بهره وری ازشاخص ترنکوئیست با نرم افزارtfpipاستفاده گردیده است. یافته- های پژوهش بیانگر آن است که بهره وری محصول ارگانیک و غیرارگانیک از لحاظ آماری تفاوت معنی دار ندارند و فقط تاثیر گذاری متغیرها بر بهره وری در دو گروه متفاوت می باشد. درتابع ارگانیک بیشترین تاثیر را زمین و در غیر ارگانیک بیشترین تاثیر را آب مصرفی دارد. لذا برای توسعه بخش کشاورزی و حرکت به سوی کشاورزی سالم با محصولات ارگانیک توجه بیشتر دولت ضروری بوده و پیشنهاد می شود سرمایه گذاری های لازم جهت افزایش سطح زیر کشت محصولات ارگانیک و اشاعه فرهنگ مصرف محصولات ارگانیک در کشور انجام پذیرد.