هدف اصلی این تحقیق، بررسی دیدگاه مدیران و حسابرسان داخلی دانشگاههای علوم پزشکی تهران و ایران در مورد نقش حسابرسان داخلی و عوامل موثر بر اثربخشی عملکرد حسابرسی داخلی در دانشگاه است. هدف دیگر این تحقیق فراهم نمودن بینشی نسبت به فعالیتهای حسابرسی داخلی در دانشگاه و دیدگاه پاسخ دهندگان نسبت به فعالیتهای حسابرسی داخلی دانشگاه در 5 سال آینده و مشخص نمودن میزان آشنایی مدیران و کارکنان حسابرسی داخلی با فعالیت حسابرسی داخلی و استانداردهای حسابرسی داخلی است. داده ها از طریق توزیع پرسشنامه بین مدیران و حسابرسان داخلی دانشگاههای علوم پزشکی تهران و ایران جمع آوری شدند و سپس با استفاده از spss مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. نتایج این تحقیق نشان داد که از دیدگاه مدیران و حسابرسان داخلی دانشگاه، نقش های اطمینان بخشی برای حسابرسان داخلی از اهمیت بیشتری نسبت به نقش مشاوره برخوردار است و در حال حاضر وقت و تلاش زیادی صرف حسابرسی مالی و رعایت می شود اما پاسخ دهندگان فعالیتهای حسابرسی مالی و رعایت را کافی نمی دانند و بررسی دیدگاه آنها نسبت به فعالیتهای آتی حسابرسی داخلی نشان می دهد که در 5 سال آینده از حسابرسان داخلی انتظار می رود بیشتر نقش حسابرسی عملیاتی و مشاوره مدیریت را ایفا نمایند. بر اساس نتایج، می توان بیان کرد مدیران و حسابرسان داخلی دانشگاه با فعالیت حسابرسی داخلی آشنا هستند اما با استانداردهای حسابرسی داخلی تا حدودی آشنا هستند. همچنین یافته ها نشان می دهد از دیدگاه پاسخ دهندگان مهمترین عوامل موثر بر اثربخشی عملکرد حسابرسی داخلی به ترتیب گزارش یافته های حسابرسی داخلی به بالاترین مقام دانشگاه (هیئت امنا)، افزایش آگاهی و مهارت حسابرسان داخلی از طریق شرکت در دوره های آموزشی، تامین جایگاه سازمانی و استقلال حسابرسان داخلی، برقراری جلسات منظم بین مدیران و حسابرسان داخلی و پیگیری و اجرای گزارش حسابرسان داخلی، تجربه و تخصص و ارزیابی عملکرد حسابرسان داخلی هستند.