جلبک ها منابع بسیار خوبی از ترکیبات فعال زیستی می باشند. با وجود محتوای کم چربی جلبک های قهوه ای، اسیدهای چرب این جلبک ها به دلیل ارزش تغذیه ای بسیار بالا و همچنین وجود اسیدهای چرب اشباع نشده با چند پیوند دوگانه (pufa) و کاربردهای بالقوه پزشکی، علاقه بسیاری را به خود جلب کرده است. فوکوگزانتین یک نوع کاروتنوئید است که در جلبک های قهوه ای غالب است. این رنگدانه به دلیل فعالیت زیستی بسیار قوی از اهمیت ویژه ای برخوردار است. در تحقیق حاضر تغییرات فصلی چربی کل، پروفیل اسید چرب و میزان رنگدانه فوکوگزانتین دو گونه از جلبک های قهوه ای (cystoseira indica و nizamuddinia zanardini) مورد بررسی قرار گرفته است. نمونه برداری جلبک ها از سواحل صخره ای دریا بزرگ در چابهار انجام شد و به آزمایشگاه انتقال یافت و چربی کل از جلبک ها استخراج گردید. تعیین محتوای رنگدانه فوکوگزانتین با استفاده از دستگاه hplc و نمودار استاندارد رنگدانه فوکوگزانتین با خلوص بالاتر از 93% تعیین گردید. درصد اسیدهای چرب جلبک ها با استفاده از دستگاه gc، اندازه گیری شد. نتایج نشان داد که گونه های مورد بررسی دارای میزان بالایی از رنگدانه فوکوگزانتین می باشند(mg/g 17/0±65/1 برای گونه n. zanardini در تیر ماه و mg/g 2/0±56/3 برای گونه c. indica در آذر ماه) که احتمال می رود به دلیل شرایط خاص منطقه نمونه برداری از نظر استرس های اکسیداتیو چه از نظر امواج بلند در اثر اثرات مونسون تابستانه و چه استرس های گرمایی، باشد. همچنین گونه های مورد بررسی در مهر ماه و آذر ماه که همزمان با رشد و جوانه زنی جلبک ها می باشد، دارای میزان بالاتری از چربی کل بودند(mg/g 53/15±88/79 برای گونه n. zanardini و mg/g 5/6±1/86 برای گونه c. indica) اما میزان رنگدانه فوکوگزانتین در گونه c.indica بر عکس گونه n.zanardinii الگوی خاصی را نشان نداد. درصد pufa در گونه n.zanardinii همزمان با دوره سرمای نسبی افزایش پیدا کرد(%95/25 در بهمن ماه) اما در گونه c.indica در اردیبهشت ماه به اوج خود رسید(%91/37). در کل می توان گفت تغییرات فاکتورهای مورد بررسی در مناطق گرمسیری همچون چابهار بسیار متفاوت با مناطق معتدله است و همچنین این تغییرات در خیلی از موارد چندان ملموس نیست.