نام پژوهشگر: امیر مهدیان خان آبادی

بکارگیری روش های آنالیز تصویر چند متغیره و رگرسیون اسپلاین وفقی چند متغیره در مطالعات qsar بازدارنده های گلوتاتیون s-ترنسفرازp1-1 و پلاسمودیوم فالسیپاروم دی هیدروروتیت دهیدروژناز
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه علوم پایه دامغان - دانشکده شیمی 1393
  امیر مهدیان خان آبادی   مرتضی عتباتی

مقاومت در برابر داروهای شیمی درمانی به مدت طولانی به یک مانع قابل توجهی برای درمان موفقیت آمیز بسیاری از سرطان ها تبدیل شده است. gstp1-1 ها خاصیت سم زدایی داشته و این خاصیت خود را می-توانند بر روی داروهای شیمی درمانی انجام داده و میزان فعالیت دارو را کم کنند. در روش mia-qsar پیکسل هایی از عکس دو بعدی ساختار مولکول که دوتایی است گرفته می شود و با این اعداد مدل سازی صورت می گیرد. با استفاده از برنامهacd/chemsketch (2008) ساختار مشتقات 35 مولکول داروی بازدارنده gstp1-1 کشیده شده، بعد اندازه این عکس را تغییر داده به طوری که تمام مولکول ها از لحاظ مکان روی هم افتاده و ساختارهای مشترک آن ها روی هم قرار می گیرند. هر تصویر مولکول را وارد برنامه matlab کرده و ساختار های مشترک که برای همه مولکول ها یکسان است حذف می گردد. سپس هر مولکول در برنامه matlab به یک سطر تبدیل شده و همه مولکول ها پشت هم ردیف می شوند طوری که تعداد سطرها با تعداد مولکول ها برابر شود. بعد به وسیله الگوریتم مولفه های اصلی، بهترین pc ها را انتخاب کرده و با استفاده از رگرسیون mlr آنها را مدل می کنند. مقدار r2 برابر 9973/0 و rmse برابر 16/1 می-باشد. آنزیم dhodh یک آنزیم مهم برای توسعه بیماری مالاریا است. زمانی که انگل پلاسمودیوم فالسیپاروم به dhodh وارد می شود یک آنزیم مناسب برای رشد انگل های پلاسمودیوم فالسیپاروم فراهم می شود و در واقع سرعت تکثیر این انگل زیاد می شود. در روش مدل سازی mars این امکان وجود دارد تا بتوان الگوی غیر خطی پنهان در مجموعه داده های با تعداد متغیر زیاد را آشکار کرد و بدین ترتیب ضمن بکارگیری یک روش، امکان تعریف تابع تخمین ممکن می شود و ضرورتی به تلفیق چندین روش آماری وجود نخواهد داشت. tmars در واقع ترکیبی از دو روش mlr (رگرسیون خطی چندگانه) وmars (رگرسیون اسپلاین وفقی چند متغیره) است. در این مطالعه مشتقات داروی بازدارنده pfdhodh مورد بررسی قرار گرفت. پس از بهینه سازی ساختار، توصیف کننده های مختلف (1497توصیف کننده) با استفاده از نرم افزار dragon بدست می آید. بهترین توصیف کننده ها (6 توصیف کننده) با استفاده از روش گام به گام انتخاب شده و سپس mars برای مدل سازی استفاده می گردد. مقدار r2 در این روش 9552/0 و مقدار rmse برابر 2401/0 به دست آمده است.