پروتئینها ماکروملکولهایی هستند که تمام اعمال مهم در ارگانیسمها از جمله انتقال مواد غذایی، تشخیص و انتقال پیامها انجام میدهند. از آنجا که عملکرد پروتئینها وابسته به ساختار فضایی آنهاست، پیشگویی ساختار فضایی پروتئین حائز اهمیت است. هدف از این تحقیق پیشگویی ساختار پروتئین با استفاده از اطلاعات ساختاری ساختار دوم است. در روش پیشنهادی در این تحقیق، با استفاده از الگوریتم رقابت استعماری، تعدادی ساختار فوق ثانویه از پروتئین گرفته می شود و سپس بهترین ساختار فوق ثانویه پیش گویی می شود. برتری این روش نسبت به سایر روشهای موجود این است که اطلاعات ساختاری ساختار دوم به عنوان ورودی الگوریتم منجر به پیشگویی دقیقتری میشود که به ساختار فضایی پروتئین نزدیکتر است.