سروتونین (5-هیدروکسی تیریپتامین) یکی از میانجی های عصبی منوآمینی است که در بدن توسط نورونهای دستگاه گوارشی و دستگاه عصبی مرکزی ترشح می شود. در این پژوهش برهمکنش سروتونین با آلبومین سرم انسانی (hsa) و آلبومین سرم گاوی (bsa) در بافر فسفات 10میلی مولار با ph 4/7 و در دمای محیط توسط طیف سنجی فلورسانس، روش های کمومتریک، روش های داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی مورد مطالعه قرار گرفته است. نتایج آزمایش های تیتراسیون فلورسانس نشان داد که برهمکنش سروتونین با hsa و bsa با تشکیل کمپلکس فلورسنت بین لیگاند و پروتئین با استوکیومتری 1:1 همراه می باشد. مقادیر ثابت پیوندی از آنالیز داده های فلورسانس به دست آمد. داده های نشر فلورسانس پروتئین در طول موج های برانگیختگی مختلف توسط روش آنالیز فاکتورهای موازی به منظور تعیین دقیق تعداد گونه ها و پروفایل های غلظتی و طیفی آن ها مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. تعداد گونه ها به کمک روش آنالیز مولفه اصلی به دست آمد. نتایج حاکی از وجود سه گونه، پروتئین آزاد، لیگاند آزاد و کمپلکس لیگاند- پروتئین بود. تعیین دقیق الگو های غلظتی امکان تعیین ثابت اتصال سروتونین به آلبومین سرم را فراهم آورد. مقدار متوسط ثابت پیوندی برای آلبومین سرم انسانی و آلبومین سرم گاوی به ترتیب برابر با m-1 105×35/4 و m-1 105×32/2 حاصل شد، که نشان دهنده ی تمایل پیوند شدن بیشتر سروتونین به آلبومین سرم انسانی می باشد. در مرحله ی بعدی این پژوهش نحوه ی برهمکنش سروتونین با آلبومین سرم انسانی توسط روش داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی مورد مطالعه قرار گرفت. بر اساس داکینگ مولکولی، بهترین انرژی اتصال برای کمپلکس hsa-سروتونین 20/7- کیلو کالری بر مول می باشد که این انرژی برای اتصال سروتونین با جایگاه i hsa است. نتایج داکینگ مولکولی نشان داد که جایگاه پیوندی فعال اصلی برای کمپلکس سروتونین جایگاه i است. علاوه براین نتایج شبیه سازی دینامیک مولکولی نشان داد که این کمپلکس می تواند با hsa بدون تاثیر بر ساختار دوم hsa و تنها با ایجاد تغییرات اندکی در ساختار سوم این پروتئین، برهمکنش داشته باشد.