اسانس ریحان به طور عمده شامل ترکیبات فنیل پروپانوئیدی است. یکی از آنزیم¬های کلیدی در مسیر تولید ترکیبات فنیل پروپانوئیدی، فنیل آلانین آمونیا لیاز (pal) است. شناسایی روش¬های افزایش میزان بیان ژن pal و ازدیاد ترکیبات فنیل پروپانوئیدی درون بافت گیاهی کمک زیادی در تولید بیشتر متابولیت¬های ثانویه گیاه و دارو¬های مربوطه خواهد کرد. در این تحقیق، بیان ژن فنیل آلانین آمونیا لیاز در نمونه¬های تیمار شده با کاربرد خارجی اسپری کردن هورمون¬های اسید جیبرلیک، اسید جاسمونیک و اسید سالیسیلیک با غلظت 1/0 میلی مولار در لیتر به مدت 24 ساعت در گیاه ریحان در قالب طرح کاملاً تصادفی مورد بررسی قرار گرفت. هدف از بررسی اثر هورمون¬های مختلف و سه مرحله رشدی گیاه: بررسی تاًثیر هورمون¬های رشد و سه مرحله رشدی گیاه در بیان ژن خاص در گیاه است. تمام واکنش¬های pcr در سه تکرار برای ژن¬های pal و توبولین صورت گرفت و آنالیز داده¬ها با روش « قانون لیواک 2-∆∆ct» انجام شد. تفاوت سطح بیان ژن هدف بین تیمار¬های مختلف و نمونه¬های شاهد توسط روش دانکن محاسبه و در سطح معنی داری 1 و 5 درصد بررسی شد. همه آنالیز¬ها توسط نرم افزار sas v9 انجام شد. نتایج نشان دهنده افزایش بیان ژن pal در تیمار هورمون اسید جاسمونیک و در مرحله گلدهی بود. از لحاظ آماری تفاوت معنی داری در بیان ژن pal بین تیمار و نمونه شاهد در سطح معنی داری 1 درصد وجود داشت. تیمار اسید جاسمونیک، اسید جیبرلیک و اسید سالیسیلیک به ترتیب باعث افزایش بیان ژن pal شد.