نام پژوهشگر: شکیبا درویش علیپور آستانه

شناسایی پروتئین fha-like در acinetobacter baumannii، نقش آن در بیماریزایی و ایمنی زایی
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شاهد - دانشکده علوم پایه 1393
  شکیبا درویش علیپور آستانه   لطیف موسوی گرگری

مقدمه: پروتئین های وابسته به خانواده سیستم ترشحی دوجزئی می توانند درچسبندگی باکتری نقش داشته باشند. چسبندگی برروی سطوح، به عنوان یک عامل بیماریزایی، اولین گام در انجام فرایند تجمع باکتریایی می باشد. اسینتوباکتربومانی دارای توانایی ویژه ای برای کلونیزاسیون برروی سطوح مختلف است. هدف از انجام این تحقیق، شناسایی، مطالعه و بررسی نقش پروتئین های این خانواده در چسبندگی اسینتوباکتربومانی به سلول اپی تلیال انسانی و تشکیل بیوفیلم است. مواد و روش: در این مطالعه ابتدا هومولوگ ژن های کد کننده پروتئین چسبندگی، وابسته به سیستم ترشحی دوجزئی در ژنوم اسینتوباکتربومانی با کمک نرم افزارهای بیوانفورماتیک در بانک ژنی آنالیز و سپس آغازگرها طراحی شدند. دو ادهسین غشای خارجی مشابه به پروتئین های fha که ترکیبی از اگزوپروتئین fhab (fhab1 & fhab2) و پروتئین کانال fhac (fhac2 & (fhac1 است، همسانه سازی شدند. بیان هر یک از اگزوپروتئین ها و کانال مربوط به آن (fhab1& fhac1) و(fhab2&fhac2) تحت کنترل دو پروموتور مجزا در یک سلول به نام fhab1c1 و fhab2c2 و همچنین هریک در سلول مجزا fhab1 و fhab2 مورد ارزیابی قرار گرفت. میزان بیان پروتئین های مورد مطالعه در سطح غشای خارجی سلول باکتری ارزیابی شد. سپس ژن های کد کننده پروتئین های کانال fhac1 و fhac2 جهش یافته و همراه با اگزوپروتئین مرتبط خود به سلول اشریشیاکلی bl21de3 ترانسفورم شدند. محصول این ترانسفورم به نام سلول های mfhab1c1 و mfhab2c2 نام گذاری شدند. توانایی چسبندگی به سلول های اپی تلیال انسانی این سویه های نوترکیب با سویه های جهش یافته و اسینتوباکتربومانی در شرایط آزمایشگاهی مقایسه شد. همچنین توانایی تشکیل بیوفیلم روی سطوح غیرزنده در سویه های جهش یافته با اسینتوباکتربومانی، fhab1c1، fhab2c2 مقایسه شدند. در مرحله بعد پروتئین کایمر(k) که ترکیبی از منطقه آنتی ژنی درقسمت های حفاظت شده اگزوپروتئین (b) و کانال (c) است، سنتز شد. از آنتی بادی علیه پروتئین کایمر برای شناسایی بیان پروتئین های نوترکیب تولید شده در آزمایشگاه، استفاده شد. سپس موش های ایمن شده با هر یک از پروتئین های کانال، اگزوپروتئین و کایمر در برابر اسینتوباکتربومانی وfhab1c1 چالش یافتند. یافته ها ونتایج: دو محصول ژنی از پروتئین های سیستم ترشحی دو جزئی اسینتوباکتربومانی atcc19606 شناسایی شده، به نام اگزوپروتئین fhab2) و fhab1 ) و کانال(fhac1و(fhac2 شناخته شده اند. دو هومولوگ پروتئین fha ، fhab1 با وزن مولکولی 110کیلودالتون و fhab2 با وزن مولکولی 190 کیلودالتون حدودا 48% تشابه دارند که به دلیل حضور موتیف چسبندگی npgx است که در تشکیل بیوفیلم نقش دارد. قرار گرفتن اگزوپروتئین در سطح غشای خارجی سلول به روش الایزای سلول کامل و وسترن بلات تایید شده است. سلول های جهش یافته mfhab1c1,mfhab2c2 فاقداگزوپروتئین fhab در سطح غشای خارجی است. بیان اگزوپروتئین در سلول fhab1c1 سبب افزایش چسبندگی سویه های نوترکیب به سلول های اپی تلیال ریه a549 و helaمی شود. نتایج آزمایشات نشان داده است که fhab1 سبب افزایش چسبندگی باکتری و تشکیل بیوفیلم می شود. تشکیل بیوفیلم روی سطوح پلی استرن در سویه های fhab1c1 و fhab2c2 بیشتر از سایر گروه ها بوده است. سویه های هیدروفوبیک ظرفیت بیشتری برای تشکیل بیوفیلم نشان داده اند. ایمنی زایی با پروتئین های نوترکیب b و k حیوان را در برابرآلودگی اسینتوباکتربومانی و fhab1c1 حفاظت می کند. بحث: دمین fha نقش بسیار مهمی در تشکیل بیوفیلم و چسبندگی اسینتوباکتربومانی به بافت و شکل گیری بیوفیلم ایفاء می کند و بر اساس نتایج این مطالعه اگزوپروتئین های وابسته به سیستم ترشحی دو جزئی می تواند در ایمنی زایی فعال و غیر فعال بر علیه اسینتوباکتربومانی بکاررود.

تاثیر پروتئین نوترکیب oprf در ایجاد ایمنی علیه سودوموناس آئروجینوزا
پایان نامه وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شاهد - دانشکده پزشکی 1393
  زهره رسولی   پرویز اولیا

مقدمه و هدف: سودوموناس آئروجینوزا (pseudomonas aeruginosa) مقام سوم ایجاد عفونتهای بیمارستانی و مقام اول در بخش سوختگی را دارا است. مقاومت بالای این باکتری نسبت به مواد ضد میکروبی از جمله آنتی بیوتیک ها باعث پیچیده تر شدن درمان عفونتهای ناشی از این باکتری شده است و بنابراین محققان تمرکز فعالیت های خود را روی تحقیقات واکسن گذاشته اند. آزمایشات بالینی متعددی نشان می دهد که فلاژل و دو پروتئین غشا خارجی به نام هایoprf و opriاز نظر توالی های مربوط به خاصیت آنتی ژنی در سویه های مختلف باکتری p. aeruginosa حفاظت شده اند. بنابراین ایمن سازی با آنتی ژن حفاظت شده ای مانند oprf می تواند در مبارزه با بیشتر یا تمام سروتیپ هایp. aeruginosa امید بخش باشد. با این نگرش این تحقیق با هدف ایمنی زایی پروتئین نوترکیب oprf علیه سودوموناس آئروجینوزا طراحی و مورد بررسی قرار گرفت. روش اجرای پژوهش: ابتدا ژن oprf با روش pcr تکثیر و پس از هضم با آنزیم های محدودگر hindiii و xho i واکنش الحاق توسط آنزیمdna لیگازt4در وکتور pet28a(+) انجام شد. پلاسمیدdna نوترکیب به سلول مستعد e. colibl21)de3) به عنوان میزبان بیانی انتقال و پروتئین بیان شده پس از تایید و تخلیص به مدل های سوختگی حیوانی در گروه های مختلف موش تزریق و نتایج مورد ارزیابی قرار گرفت. یافته ها و نوآوری پژوهش: موش هایbalb/c با استفاده از پروتئینoprf ایمن و تیتر آنتی بادی با آزمایش الایزا تعیین شد. به منظور ارزیابی ایمنی سطح مشخصی از موش های ایمن را سوزانده و با p. aeruginosa مورد چالش قرار دادیم. کاهش معنی داری (p <0.001) درمیزان باکتریها در پوست، خون وارگان های داخلی بدن در موش ایمن آلوده به سودوموناس نسبت به گروه کنترل مثبت مشاهده شد. داده ها نشان می دهد کهigg ضدoprf نقش مهمی در مهار گسترش سیستمیک سودوموناس ازناحیه عفونت به ارگان های داخلی بدن ایفا می کند. ایمنی با پروتئینoprf مانع گسترش عفونت در بدن میزبان گردید.