نام پژوهشگر: آزاده تقوی
آزاده تقوی محمدهادی معظم
بررسی اختلافات ژنتیکی بین انسان ها گواه این است که جهش در توالی dna باعث بیماریهای ژنتیکی زیادی می شود .بنابراین بکمک توالی کامل ژنوم که برای انسان ها و موجودات دیگر در دسترس می باشد ، بررسی اختلافات ژنتیکی یا پلی مورفیسم ، مسئله مهمی می باشد . برای بازسازی جفتی از هاپلوتایپ ها از مقادیر snp موجود در توالی dna از اسمبلی هاپلوتایپ استفاده می شود . استنتاج هاپلوتایپها از طرق آزمایشگاهی موجب تحمل هزینه های مالی و زمانی هنگفت است ، از اینرو بازسازی آنها از قطعات snp ، توسط روشهای محاسباتی در کانون توجه محققان محاسبات مولکولی می باشد . کار ما بر روی مسئله بازسازی هاپلوتایپ ها از یک فرد خاص می باشد . بازسازی هاپلوتایپ ها ، ساختن هاپلوتایپهای یک فرد از بین قطعات snp آن فرد می باشد . به این منظور ، در ابتدا از روی کروموزوم ها چند نسخه ایجاد نموده ، سپس کروموزوم ها قطعه قطعه می شود و از روی قطعات ، snpها مشخص می شوند و مقادیر آنها بصورت یک ماتریس نمایش داده می شود . در نهایت هاپلوتایپ ها از روی ماتریس حاصل ، با استفاده از روش های محاسباتی و الگوریتمی بدست می آیند . متناسب اشتباهی که در داده های مسئله رخ می دهد مدلهای حل گوناگونی از جمله mec ، mfr ،msr ، mcih و wmlf برای این مسئله ارائه شده است . ما بر روی مطالعه مدل mec برای مسئله اسمبلی هاپلوتایپ تمرکز می کنیم و روش som و fuzzy c-means را جهت حل این مسئله ارزیابی می کنیم .