بالغ بر سی هزار مجروح شیمیایی از جنگ تحمیلی هشت ساله به جای مانده است. گاز خردل از جمله گازهای شیمیایی تاول زاست که بارها توسط رژیم بعث عراق علیه رزمندگان ایرانی و مردم بی دفاع ایران و عراق مورد استفاده قرار گرفت. یکی از ضایعات دیررس گاز خردل بر روی چشم قربانیان، آسیب های ساختاری قرنیه و اختلالات اشکـی می باشد. رگ زایی در قرنیه از مهمترین عوامل تخریب قرنیه این دسته از قربانیان است.مایع زلالیه به واسطه برخی پروتئین های خود نقش مهمی در مهار رگ زایی در قرنیه ایفا می کند. در این کار فرض بر این بود که منشأ رگ زایی در قرنیه قربانیان شیمیایی با عملکرد و محتوای پروتئوم مایع زلالیه مرتبط باشد. برای آزمودن این فرضیه نیاز به انجام پروتئومیکـس مقایسه ای بین گروه قربانیان شیمیایی و گروه شاهد می باشد. یکی از مهمترین چالش ها در پروتئومیکس بر پایه ژل دو بعدی، بدست آوردن یک ژل با کیفیت بالا می باشد. در این مطالعه ابتدا روش های بدون رسوب گیری آزموده شدند، در نهایت از بین روشهای رسوب گیری مختلف، رسوب گیری با استون به منظور رسیدن به ژلی با بیشترین لکه های پروتئین و کمترین پس زمینه انتخاب گردید. مقادیر و ترکیبات موجود در بافرهای باز محلول سازی و بازآبدهی نیز بهینه شدند. با اعمال شرایط بهینه در نهایت ژلی با کیفیت قابل قبول برای آنالیز مقایسه ای بعدی پروتئوم مایع زلالیه قربانیان و گروه شاهد به هدف شناسایی پروتئین های دخیل در بروز عوارض دیررس چشمی بدست آمد.