بیش از %90 موارد عفونت های مجاری ادراری در زنان ناشی از دو میکروارگانیسم ¬اشرشیا کولی¬(escherichia coli) و استافیلوکوک ¬ساپروفیتیکوس (staphylococcus saprophyticus) هستند و حداقل 80 درصد از موارد uti از اشرشیا کولی(e. coli) ناشی می¬شوند. از جمله پاتوژن¬های کمتر شایع می¬توان به کلبسیلا پنومونیه (klebsiella pneumonia)، سودوموناس¬ آئروجینوزا pseudomonas aeruginosa))، انتروکوکوس ¬فکالیس (enterococcus faecalis) اشاره کرد. در این مطالعه جداسازی و شناسایی عوامل عفونی ادراری زنان و بررسی تنوع ژنتیکی آن¬ها مورد بررسی قرار گرفت. در این مطالعه نمونه¬های باکتریایی گرم¬منفی اشرشیا کولی، سودوموناس ¬آئروجینوزا ، کلبسیلا پنومونیه و گرم¬مثبت انتروکوکوس -فکالیس از بیمارستان امام¬خمینی تهیه شد. dna¬ های استخراج شده با استفاده از پرایمر¬های اختصاصی ژن های ( pap،fimk ، algd ، ace، efaa ،gele) تکثیرو سپس تعیین توالی گردید. تنوع ژنتیکی با استفاده از نرم¬افزارهای تخصصی با توالی¬های ژنی موجود در پایگاه اطلاعاتی ncbi مقایسه و بررسی گردید. نتایج حاصل از انطباق توالی نوکلئوتیدی ژن fimk جدا شده از نمونه¬های باکتریائی حاکی از این است که این باکتریها متعلق به گونه¬ی کلبسیلا پنومونیه دارند. نتایج حاصل از درخت فیلوژنتیکی رسم¬شده برای ژن¬های fimk(kf1,kf2.kf3) با یکدیگر نشان داد که ژن fimk(kf1) درصد واگرایی کمتری با ژن fimk(kf3) نسبت به ژنfimk(kf2) دارد. نتایج حاصل از انطباق توالی نوکلئوتیدی ژن algd جدا¬شده از سویه ¬های باکتریائی حاکی از این است که سویه های جدا¬شده متعلق به گونه سودوموناس ¬آئروجینوزا می¬باشند. نتایج درصد واگرایی ژن algd نشان داد که ژن algd(aa1) درصد واگرایی بالاتری نسبت به algd(aa2) با سویه¬های حاوی این ژن دارد. نتایج حاصل از انطباق توالی نوکلئوتیدی ژن ace جدا¬شده از نمونه¬های باکتریائی حاکی از این است که باکتریهای جدا¬شده متعلق به گونه¬ی انتروکوکوس ¬فکالیس می¬باشد. نتایج حاصل از درخت فیلوژنتیکی رسم شده برای ژن¬های ace(ea1,ea2,ea3) با یکدیگر نشان داد که ژن ace(ea1) درصد واگرایی کمتری با ace(ea3) نسبت به ace(ea2) دارد. نتایج حاصل از انطباق توالی نوکلئوتیدی ژن efaa جدا¬شده از نمونه¬ها حاکی از این است که این سویه جدا¬شده متعلق به گونه¬ی انتروکوکوس ¬فکالیس می¬باشد. نتایج حاصل از درخت فیلوژنتیکی رسم شده برای ژن¬های efaa(ee1,ee2,ee3) با یکدیگر نشان داد که ژن efaa(ee1) درصد واگرایی کمتری با ژن efaa(ee2) نسبت به efaa(ee3) دارد.. نتایج حاصل از انطباق توالی نوکلئوتیدی ژن gele جدا¬شده از سویه ¬های باکتریائی حاکی از این است که این سویه های جدا¬شده متعلق به گونه¬ی انتروکوکوس ¬فکالیس می¬باشند. ژن gele(eg1) نسبت به gele(eg2) درصد واگرایی کمتری با سویه¬های موجود در پایگاه اطلاعاتی دارد. نتایج حاصله از این تحقیق مشخص می کند که ژن¬های موثر در ایجاد عفونت ادراری زنان جدا سازی شده در داخل ایران با یکدیگر واگرایی داشته، هم چنین ژن های مورد مطالعه با سایر نقاط جهان واگرایی نشان داد، بنابراین تنوع ژنتیکی در بین عوامل عفونی ادراری زنان تهیه واکسن مناسب را دشوار می¬سازد. پیشنهاد می شود از مناطق حفاظت¬شده برای طراحی واکسن علیه عفونت ادراری استفاده شود. .